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蘇尼特家養雙峰駝mtDNA Cytb基因和D-loop序列的遺傳多樣性

2015-02-24 08:43張成東任戰軍楊雪嬌
關鍵詞:蘇尼特家養密碼子

張成東,任戰軍,楊雪嬌

(西北農林科技大學 動物科技學院,陜西 楊凌 712100)

蘇尼特家養雙峰駝mtDNACytb基因和D-loop序列的遺傳多樣性

張成東,任戰軍,楊雪嬌

(西北農林科技大學 動物科技學院,陜西 楊凌 712100)

【目的】 研究蘇尼特家養雙峰駝的遺傳多樣性,以全面揭示中國雙峰駝的起源進化,為科學保護和利用我國的雙峰駝遺傳資源奠定基礎?!痉椒ā?采集15峰蘇尼特家養雙峰駝(10峰雄駝和5峰雌駝)的血樣,提取其DNA,采用PCR方法擴增線粒體DNA(mtDNA)細胞色素b (Cytb)基因的全序列及D-loop的671 bp序列,進行遺傳多樣性分析,并結合GenBank中已有的雙峰駝的mtDNACytb基因序列和D-loop序列進行系統發育分析?!窘Y果】 蘇尼特家養雙峰駝mtDNACytb基因中存在10個變異位點,共形成了7種單倍型,單倍型多樣度為0.857±0.065,核苷酸多樣度為0.001 94±0.002 70,平均核苷酸差異數為2.210;在D-loop的671 bp序列中,存在6個變異位點,共定義了6種單倍型,單倍型多樣度為0.714±0.116,核苷酸多樣度為0.002 53±0.002 75,平均核苷酸差異數為 1.695?;贑ytb基因和D-loop序列進行的系統發育分析均顯示,蘇尼特家養雙峰駝與野生雙峰駝歸于2個不同的母系世系,野生雙峰駝不是蘇尼特家養雙峰駝的直接祖先?!窘Y論】 蘇尼特家養雙峰駝mtDNACytb基因和D-loop序列遺傳多態性均比較豐富;蘇尼特家養雙峰駝與野生雙峰駝歸于2個不同的母系世系,野生雙峰駝不是蘇尼特家養雙峰駝的直接祖先;家養雙峰駝內部存在著一定的遺傳分化。

蘇尼特家養雙峰駝;mtDNACytb基因;mtDNA D-loop序列

家養雙峰駝隸屬哺乳動物偶蹄目(Artiodactyla),駱駝科(Camelidae),駱駝屬(Camelus),雙峰駝(Camelusbactrianus)種。我國家養雙峰駝主要分布于內蒙古、新疆、甘肅、青海、寧夏5個省區的荒漠和半荒漠地區,是沙漠和荒漠地區人民生活不可缺少的畜力之一。由于主產區相距較遠,駱駝品種間血液交流較少,加之受現代交通、農業發展和駝產品開發的影響,駱駝存欄量急速下降,導致品種遺傳資源急劇衰竭。因此,揭示各產區家養雙峰駝群體的遺傳多樣性和血緣來源,理清起源進化關系,對駱駝群體遺傳資源的保護和開發利用有重要意義。

在家養動物的起源進化研究中,最基本的科學問題是野生祖先的來源、起源地及馴化時間[1]。Stanley等[2]首次對駱駝屬物種的線粒體DNA(mtDNA)細胞色素b(Cytb)基因全序列進行了分析,得出的Camelini-Lamini的分化時間與化石記錄一致。這引發了人們用分子學研究方法對家養雙峰駝野生祖先來源的不斷探索。Wang等[3]認為,駱駝與偶蹄目動物的分化時間為5 500~6 000萬年前。Cui等[4]認為,雙峰駝和單峰駝在從北美洲往亞洲遷徙之前已經分化。Han等[5]利用EcoRⅠ、PvuⅡ、ScaⅠ內切酶對我國雙峰駝資源進行了限制性片段長度多態性(RFLP)分析,發現野生雙峰駝和家養雙峰駝線粒體基因的酶切條帶存在差異,這從一個側面為野生雙峰駝是不同于家養雙峰駝的物種提供了分子學證據。而吉日木圖[6]研究認為,現存的野生雙峰駝具有遠古血統和系譜,是家養雙峰駝的祖先,其在進化上的分歧時間為600萬年。此后,高宏巍等[7]用基因組DNA微衛星標記分析認為,野生雙峰駝既不是家養雙峰駝的祖先,也不是從家養雙峰駝野化而來的。張勇等[8]分析了2峰阿爾金山野生雙峰駝和已有的雙峰駝的mtDNACytb基因序列,表明現有的雙峰駝可分為2個種群:新疆種群和甘肅種群(二者尚未達到種間水平),二者可能是由2個不同的原始雙峰駝祖先種群進化而來的(阿爾金山野生雙峰駝屬于新疆種群)。程佳等[9]分析了家養雙峰駝和野生雙峰駝mtDNACytb的部分基因序列,結果表明家養雙峰駝起源于同一母系,與野生雙峰駝非同一母系起源,認為我國家養雙峰駝的祖先與現存的野生雙峰駝并非同一個亞種。Ji等[10]對 3 峰野生雙峰駝和 18 峰家養雙峰駝的mtDNACytb基因序列進行了分析,認為現存的野生和家養駱駝有各自獨立的母系起源,而且2個亞種之間的分化可能發生在 70 萬年前。以上研究表明,家養雙峰駝的野生祖先來源存在一定分歧,而且其起源地及馴化時間等問題也未得到解決,有待進一步研究。

我國駱駝分布在面積約1.1×107km2的干旱荒漠草原上,占我國國土總面積的11.4%,地跨北緯37°~50°、東經76°~124°。依據駱駝生存的地理環境差異及其表型差異,可將其劃分為新疆南疆駝、北疆駝、東疆駝,甘肅河西駝,青海駝,內蒙古阿拉善駝和蘇尼特駝等地方品種。近年來,對家養雙峰駝各地方品種間的遺傳差異性研究已有一些報道,權潔霞等[11]利用ApaⅠ、AvaⅠ等18種限制性內切酶對阿拉善沙漠駝、阿拉善戈壁駝和新疆駝3個類群87峰個體的mtDNA進行了限制性片段長度多態性(RFLP)分析,結果表明我國的家駝mtDNA內存在較豐富的遺傳多樣性,mtDNA在這3個類群之間沒有明顯的遺傳分化,遺傳變異主要來自群體內的差異。高宏巍等[7]首次用雙峰駝基因組DNA 16個微衛星標記,對中國6個地區和蒙古國7個地區(含5峰野駱駝)的雙峰駝進行了研究,結果表明中國和蒙古國家養雙峰駝群體間遺傳分歧并不顯著。王樂等[12]、何曉紅等[13]采用微衛星標記對中國不同地區的駱駝進行遺傳多樣性分析,將中國駱駝劃分為2個支系(阿拉善駝、河西駝、東疆駝聚為一個支系,北疆駝和南疆駝聚為另一個支系)。程佳[14]、何曉紅[15]對中國家養雙峰駝mtDNA D-loop區序列的分析表明,中國家養雙峰駝的遺傳多樣性較為豐富,家養雙峰駝存在一次不完全的群體擴張。以上研究結果表明,中國家養雙峰駝各種群間存在一定的遺傳分化,但因樣本含量和研究方法的不同,各種群間的遺傳分化結果存在差異,需要擴大樣本量和采用多種研究方法進行深入研究。

綜上可知,分析mtDNACytb基因和D-loop序列都是研究駱駝母系起源進化的有效手段,但是聯合使用這2個基因片段進行研究的文獻較少。為了更全面地揭示蘇尼特家養雙峰駝的遺傳多樣性水平及其系統地位,本研究擬聯合使用mtDNACytb基因和D-loop序列,來研究蘇尼特家養雙峰駝的遺傳多樣性及其起源進化問題,以期為科學保護我國的雙峰駝遺傳資源提供科學依據。

1 材料與方法

1.1 樣本采集與處理

在內蒙古錫林郭勒盟蘇尼特右旗,共采集15峰家養雙峰駝(10峰雄駝和5峰雌駝)頸靜脈血樣10 mL/峰,用ACD抗凝劑抗凝,冰凍帶回實驗室,-80 ℃保存。

1.2 引物設計與合成

Cytb基因引物使用項目組設計的引物[9],D-loop序列引物使用文獻[14]所用的引物。引物由生工生物工程(上海)股份有限公司合成,其相關信息見表1。

1.3 試驗方法

1.3.1 基因組DNA的提取 駱駝基因組總DNA用血液基因組柱式小量提取試劑盒(來自康威世紀生物科技有限公司)提取,用EpochTM微孔板分光光度計進行核酸定量,并用10 g/L的瓊脂糖凝膠電泳檢測其質量濃度和純度,質量濃度統一稀釋為50 ng/μL,-20 ℃冰箱保存。

1.3.2 mtDNACytb基因和D-loop序列的PCR擴增 各目的基因片段擴增體系均為50 μL,其中2×TaqMaster Mix(含染料) 25 μL、上游和下游引物各2 μL、DNA模板2.5 μL、ddH2O 18.5 μL。擴增程序:95 ℃ 5 min;94 ℃ 30 s,退火(溫度依引物而定)40 s,72 ℃ 40 s,34個循環;72 ℃ 10 min,4 ℃保存。PCR擴增產物經15 g/L瓊脂糖凝膠電泳檢測后,送生工生物工程(上海)股份有限公司進行純化和雙向測序。

1.4 測序結果處理及系統發育樹的構建

參照GenBank中的基因序列,用DNAMAN軟件對測得的Cytb基因片段進行拼接,用Chromas Application 2.3.0.0軟件對所測序列峰值進行校正,校對后用MEGA 5.10篩選出不同序列間的變異位點、簡約信息位點,確定單倍型。用DNAsp 計算單倍型多樣度(Hd) 和核苷酸多樣度(Pi),統計Cytb基因同義密碼子的相對使用度。用MEGA 5.10 計算不同單倍型間的遺傳距離,構建NJ分子系統進化樹。

2 結果與分析

2.1 駱駝基因組DNA的提取

由圖1可見,提取的雙峰駝基因組DNA濃度和純度均較高,提取效果較好,可以用于后續的基因擴增操作。

2.2 基于mtDNA Cyt b基因的蘇尼特雙峰駝的遺傳多樣性

2.2.1 mtDNACytb基因的PCR擴增結果 由圖2可知,Cytb基因的引物能擴增出特異性目的條帶,擴增長度為1 140 bp,涵蓋了Cytb基因1 140 bp全長序列,可以用于進行后續的測序工作。

2.2.2 mtDNACytb基因的堿基組成及變異 測序得到的15條蘇尼特家駝mtDNACytb基因序列,經過序列峰值校正并與GenBank所檢索到的家養雙峰駝的mtDNA全序列(GenBank序列號:AP003423.1)同源比對后,剪切得到了1 140 bp 的Cytb基因全序列。本研究發現,蘇尼特家養雙峰駝mtDNACytb基因共有10個變異位點,形成了7種單倍型(H1,H2,H3,H4,H5,H6,H7;表2),變異位點占分析位點總數的0.88%,分別位于Cytb基因的261,472,714,723,819,862,911,960,1 000和1 020 bp處,包括8個轉換和2個顛換,無插入/缺失突變;有6個簡約信息位點。8個轉換位點中,T-C轉換位點有7個,共發生13次轉換;A-G轉換位點1個,共發生2次轉換。2個顛換位點中,A-C顛換位點1個,共發生1次顛換:A-T顛換位點1個,共發生2次顛換。轉換/顛換(R,由DNAsp軟件計算得來)為4.82。由表2可知,Cytb基因472,819,1 000 bp處為非同義突變,分別導致了Cytb第158個氨基酸由蘇氨酸(T)轉變為脯氨酸(P)、第304個氨基酸由異亮氨酸(I)轉變為蘇氨酸(T)、第334個氨基酸由蘇氨酸(T)轉變為丙氨酸(A)。表明蘇尼特家養雙峰駝Cytb基因符合中性進化。

圖1 蘇尼特家養雙峰駝基因組DNA的提取
M.DNA分子量標準;S1M~S5M.5峰雌駝;S1G~S10G.10峰雄駝。圖2,4同
Fig.1 DNA of Sunite domestic bactrian camel
D.DNA Marker;S1M-S5M.5 femal camels;S1G-S10G.10 male camels.The same for Fig.2 and Fig. 4

圖2 蘇尼特家養雙峰駝Cytb基因的PCR擴增結果
Fig.2 Amplification ofCytbgene of Sunite domestic bactrian camel

堿基組成分析結果(表3)表明,T、C、A、G的平均含量分別為27.8%,28.2%,29.0%和15.0%。A+T的平均含量(56.8%)高于C+G的平均含量(43.2%)。在Cytb基因中,堿基的使用在密碼子的3個位點存在差異,在密碼子第1位點4種堿基除A堿基(28.9%)含量略高外,其余堿基使用較為均衡;密碼子第2位點和第3位點堿基的使用有明顯的偏倚性,密碼子的第2位點T堿基平均使用頻率高達41.8%,G堿基平均使用頻率為13.9%;密碼子的第3位點A堿基平均使用頻率為38.6%,A+C的平均使用頻率高達73.2%,G堿基平均使用頻率僅為8.4%。由表4可知,15峰蘇尼特家養雙峰駝mtDNACytb基因中,不同密碼子的相對使用度(RSCU值)不同,RSCU>1的密碼子除CGT(R)外均以A或C結尾,說明NNA和NNC型密碼子是Cytb基因偏愛的密碼子,而以T和G結尾的密碼子RSCU值多小于1,說明以T或G結尾的密碼子出現的頻率較低,是Cytb基因非偏愛的密碼子。

表3 蘇尼特家養雙峰駝mtDNACytb基因的堿基組成
Table 3 Base composition in mtDNACytbgene of Sunite domestic bactrain camel

注:A-1表示密碼子1位為A堿基。其他情況依此類推。

Note:“A-1” represents that the first site of a codon is A.The similar for other cases.

在7種單倍型中,H1為優勢單倍型,單倍型頻率為33.33%(表2),單倍型多樣度為0.857±0.065,核苷酸多樣度為0.001 94±0.002 70,平均核苷酸差異數為2.210。表明蘇尼特家養雙峰駝群體的mtDNACytb基因遺傳多樣性比較豐富。變異位點的Tajima’s D值(由MEGA 5.10軟件計算得到)為-1.071 66,P>0.10,差異不顯著,說明蘇尼特家養雙峰駝mtDNACytb基因符合中性進化。

2.2.3 mtDNACytb基因不同單倍型間的遺傳距離 由表5可知,蘇尼特雙峰駝Cytb基因不同單倍型間的遺傳距離為0.001~0.005,平均遺傳距離為0.002。單倍型H7與其他單倍型的遺傳距離較遠,為0.004~0.005,平均為0.004,遠大于種內平均遺傳距離0.002。野生雙峰駝與蘇尼特家養雙峰駝的遺傳距離為0.026~0.028,平均遺傳距離為0.027。H2單倍型與野生雙峰駝的遺傳距離較近,為0.026;H3和H5單倍型與野生雙峰駝的遺傳距離最遠,為0.028。單峰駝與雙峰駝的種間遺傳距離為0.105~0.116,平均遺傳距離為0.108;羊駝與駱駝屬的遺傳距離為0.171~0.183,平均遺傳距離為0.175,單峰駝與羊駝的遺傳距離最遠,為0.183。

注:FE、DR、LP分別為野生雙峰駝、單峰駝、羊駝;對角線下方為遺傳距離,對角線上方為標準誤。表9同。

Note:FE,DR,and LP represent wild bactrain camel,dromedary camel and lama,respectively.Below the diagonal are genetic distance while above the diagonal are standard error.The same for Table 9.

2.2.4 mt DNACytb基因分子系統進化樹的構建 根據表6中Cytb基因序列,用MEGA 5.10軟件,以單峰駝和羊駝為外群,基于Kimura 2-parameter Model,采用NJ法構建蘇尼特家養雙峰駝的分子系統進化樹(圖3)。由圖3可以看出,家養雙峰駝與野生雙峰駝聚為不同類群,形成一個獨立的支系,說明野生雙峰駝不是家養雙峰駝的祖先。

注:括號中的數據為序列的GenBank登錄號。表10同。

Note:The numbers in brackets represent the GenBank numbers of sequences.The same for Table 10.

2.3 基于mtDNA D-loop序列的蘇尼特雙峰駝的遺傳多樣性

2.3.1 D-loop序列的PCR擴增結果 由圖4可見,PCR擴增出約1 300 bp的特異性目的條帶,涵蓋了D-loop序列的全長序列,擴增效果較好,擴增產物可以用于膠回收以及后續的測序工作。

2.3.2 D-loop序列的測定 家養雙峰駝的D-loop序列全長1 225~1 247 bp,由于D-loop序列中存在連續的Poly G和Poly C結構,造成堿基讀取困難,經過序列峰值校正并與GenBank所檢索到的家養雙峰駝的mtDNA全序列(GenBank序列號:AP003423.1)同源比對、剪切后,本試驗只獲得了671 bp的可靠序列。對所測的15條序列進行分析發現,蘇尼特家養雙峰駝D-loop部分序列存在6個變異位點,形成了6種單倍型(H1,H2,H3,H4,H5,H6;表7),占分析位點總數的0.89%,變異位點分別位于所研究序列的第54,112,161,614,663和666位點,包括5個轉換,1個顛換;有4個簡約信息位點。A-G轉換占變異位點的50%,T-C占33.33%。所研究序列的核酸組成分析結果(表8)顯示,T、C、A、G堿基的平均含量分別為26.7%,26.8%,27.9%和18.6%,其中A+T的平均含量(54.6%)高于C+G的平均含量(45.4%)。

6種單倍型中,H1單倍型為優勢單倍型,單倍型頻率為33.33%(表7),單倍型多樣度為0.714±0.116,核苷酸多樣度為0.002 53±0.002 75,平均核苷酸差異數為1.695。變異位點的Tajima’s D值為-0.284 63,P>0.10,差異不顯著,說明蘇尼特家養雙峰駝D-loop序列符合中性進化。

2.3.3 D-loop序列不同單倍型間的遺傳距離 由表9可知,蘇尼特家養雙峰駝D-loop序列不同單倍型間的遺傳距離為0.002~0.006,平均遺傳距離為0.004。單倍型H6與單倍型H1、H2、H3和H4的遺傳距離較遠,為0.005~0.006,平均為0.006,大于種內平均遺傳距離0.004。野生雙峰駝與蘇尼特家養雙峰駝的遺傳距離為0.022~0.025,平均遺傳距離為0.024。單峰駝與雙峰駝的種間遺傳距離為0.045~0.054,平均遺傳距離為0.051;羊駝與駱駝屬的遺傳距離為0.077~0.095,平均遺傳距離為 0.092,單峰駝與羊駝的遺傳距離最近,為0.077。

2.3.4 mtDNA D-loop序列分子系統進化樹的構建 用表10中的D-loop序列,以單峰駝和羊駝為外群,用MEGA 5.10軟件,基于Kimura 2-parameter Model+G模型,采用NJ法構建蘇尼特家養雙峰駝的分子系統進化樹(圖5 )。由圖5可以看出,家養雙峰駝與野生雙峰駝聚為不同支系,說明野生雙峰駝不是家養雙峰駝的祖先;不同地區的家養雙峰駝存在基因交流,但也有分化的趨勢。

3 討 論

3.1 基于mtDNA Cyt b基因對蘇尼特家養雙峰駝的遺傳多態性研究

由mtDNACytb基因序列分析可知,蘇尼特家養雙峰駝遺傳多樣性比較豐富。由mtDNACytb基因系統進化樹可知,家養雙峰駝基本屬于一個母系世系,而與野生雙峰駝明顯屬于不同的母系世系。在家養雙峰駝世系內,S8G、S10G、Normal 1和Mongolia聚為一類,并且遺傳距離計算顯示S8G和S10G與Normal 1、Mongolia遺傳距離均為0.001(數據未展示);阿拉善家養雙峰駝(Alashan 2和Alashan 3)與其他雙峰駝遺傳距離較遠,Alashan 3與Mongolia的遺傳距離最遠,為0.009,與S8G和S10G的遺傳距離為0.008;雙峰駝Alashan 1、Wuwei 29、Wuwei 32及新疆博樂地區的Xinjiang 1、Xinjiang 2、Xinjiang 3與蘇尼特家養雙峰駝的遺傳距離均較近,說明蘇尼特家養雙峰駝與中國其他駱駝產區家養雙峰駝以及蒙古家養雙峰駝均存在基因交流。

蘇尼特家養雙峰駝mtDNACytb基因不同單倍型間的遺傳距離為0.001~0.005,平均遺傳距離為0.002,單峰駝與雙峰駝的種間遺傳距離為0.105~0.116,平均遺傳距離為0.108,這與張勇等[8]的研究結果一致。野生雙峰駝與蘇尼特家養雙峰駝的遺傳距離為0.026~0.028,平均遺傳距離為0.027,與Ji等[10]的研究結果基本一致,遠大于家養雙峰駝不同類群之間的遺傳距離,但是小于單峰駝與雙峰駝的種間遺傳距離,這說明野生雙峰駝在mtDNACytb基因上與家養雙峰駝有明顯的差異,但未達到種間差異水平。

3.2 基于D-loop序列對蘇尼特家養雙峰駝的遺傳多態性研究

由mtDNA D-loop序列NJ系統發育分析可知,家養雙峰駝屬于一個世系,而野生雙峰駝明顯屬于另一個獨立的世系,與mtDNACytb基因的分析結果一致。家養雙峰駝的母系世系可以分為3個類群:Xinjiang 24、Xinjiang 25、Xinjiang 45、Xinjiang 54聚為一類,稱之為新疆類群(群內平均遺傳距離為0);S5G、S6G、Qinghai 16、Qinghai 6、Hexi 24、Xinjiang 10、Xinjiang 11、S8G、S10G聚為一類,稱之為蒙古類群(因為依據mtDNACytb基因系統進化分析,S5G、S6G、S8G、S10G與蒙古Red、Brown、Normal、Mongolia駱駝遺傳距離較近,而與其他駱駝遺傳距離較遠,故稱之為蒙古類群,群內平均遺傳距離為0.002);其余家養雙峰駝聚為一類(群內平均遺傳距離為0.001)。3個類群間的遺傳距離分析顯示,新疆類群與蒙古類群的平均遺傳距離為 0.008,與其余家養雙峰駝類群的平均遺傳距離為0.005,蒙古類群與其余家養雙峰駝類群的平均遺傳距離為0.004,各類群間的平均遺傳距離均遠大于各類群內的平均遺傳距離,說明家養雙峰駝世系內在mtDNA D-loop區存在一定水平的分化。

依據mtDNA D-loop序列,蘇尼特家養雙峰駝平均遺傳距離為0.004,蘇尼特家養雙峰駝與野生雙峰駝平均遺傳距離為0.024,單峰駝與雙峰駝的種間平均遺傳距離為0.051,羊駝與駱駝屬的平均遺傳距離為0.092。

蘇尼特家養雙峰駝mtDNACytb基因和D-loop序列的遺傳多態性均比較豐富?;趍tDNACytb基因和D-loop序列的遺傳距離,蘇尼特家養雙峰駝各單倍型間遺傳距離較近,遠小于與野生雙峰駝間的遺傳距離?;趍tDNACytb基因和D-loop序列的系統發育分析顯示:家養雙峰駝與野生雙峰駝分別歸為2個不同的母系世系,野生雙峰駝不是家養雙峰駝的直接祖先。但是,不同地區,以及同一地區間的家養雙峰駝存在一定的遺傳分化,這些分化對研究家養雙峰駝是多母系還是單母系起源有著很高的價值,因此還需要加大品種數量,增大樣本量,進行更系統的研究。

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Genetic diversity of mtDNACytbgene and D-loop sequence of Sunite domestic bactrian camel

ZHANG Cheng-dong,REN Zhan-jun,YANG Xue-jiao

(CollegeofAnimalScienceandTechnology,NorthwestA&FUniversity,Yangling,Shaanxi712100,China)

【Objective】 The paper studied the genetic diversity of Sunite domestic bactrian camel to reveal the origin and evolution of bactrian camel in China and improve the protection and utilization of bactrian camel genetic resources.【Method】 The mtDNAcytbgene and D-loop of 15 Sunite domestic bactrian camels (10 male and 5 female) were sequenced and whole length mitochondrial DNA (mtDNA) cytochrome b (Cytb) gene and D-loop 671 bp sequence were obtained using PCR.Then genetic diversity and phylogenetic analysis were conducted based on obtained sequences and known sequences from GenBank.【Result】 There were 10 mutation sites and 7 different haplotypes inCytbgene of Sunite domestic bactrian camels,and their haplotype diversity,nucleotide diversity and average number of nucleotide differences were 0.857±0.065,0.001 94±0.002 70,and 2.210,respectively.In the 671 bp D-loop sequences,there were 6 mutation sites and 6 different haplotypes,and their haplotype diversity,nucleotide diversity and average number of nucleotide differences were 0.714±0.116,0.002 53±0.002 75,and 1.695,respectively.Neighbor joining (NJ) tree of mtDNACytbgene and D-loop sequence showed that Sunite domestic bactrian camel and wild bactrian camel belonged to two different lineages and wild bactrian camel was not the origin of domestic bactrian camel.【Conclusion】 Genetic diversity in mtDNACytbgene and D-loop of Sunite domestic bactrian camel were rich.Sunite domestic bactrian camel and wild bactrian camel belonged to two different lineages,and wild bactrian camel was not the origin of domestic bactrian camel.There was genetic differentiation in domestic bactrian camels.

Sunite domestic bactrian camel;mtDNACytbgene;mtDNA D-loop sequence

2013-10-20

國家自然科學基金項目(2010K01-16)

張成東(1985-),男,河南泌陽人,在讀碩士,主要從事動物遺傳資源研究。E-mail:897823725@qq.com

任戰軍(1966-),男,陜西淳化人,副教授,碩士生導師,主要從事經濟動物研究。E-mail:renzhanjun@nwsuaf.edu.cn

時間:2015-01-19 09:19

10.13207/j.cnki.jnwafu.2015.03.029

S824.2

A

1671-9387(2015)03-0032-11

網絡出版地址:http://www.cnki.net/kcms/detail/61.1390.S.20150119.0919.029.html

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