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浪潮發布新一代基因一體機GeneEngine M2

2017-10-17 19:38朱華樑
中國信息化周報 2017年36期
關鍵詞:浪潮英特爾數據處理

朱華樑

9月12日,浪潮聯合英特爾在北京發布新一代基因一體機浪潮GeneEngine M2。該基因一體機由浪潮研發,集成基因分析解決方案BIGstack,融合英特爾最新的計算與加速技術,實測數據顯示出全基因組分析性能較上一代產品可最大提升3倍以上。

浪潮新一代基因一體機GeneEngine M2基于英特爾BIGstack架構,內置最新的GATK3.8版本和Cromwell/WDL流程管理系統,實測數據顯示,采用雙路新一代Intel Xeon Gold處理器的浪潮基因一體機M2,關鍵業務流程序列比對和查找突變運行時間較上一代分別縮短23%和37%,而采用基于Intel Arrial10芯片的浪潮F10A FPGA卡搭配FalconComputing加速GATK的浪潮基因一體機M2,全基因分析流程時間較上一代可提升3.4倍。

當前,隨著高通量測序技術的飛速發展,單次測序數據量得到大幅提升,這為后端的基因數據計算處理帶來很大挑戰。以2017年illumina推出NovaSeq為例,單次運行40小時即可最多檢測 48 個人類基因組伴隨產生 6Tb 數據,而之前要完成單人的全基因組數據處理一般需要5天時間,基于浪潮新一代基因一體機M2,采用BIGstack集成方案配合最新的計算加速技術,使得全基因組數據處理時間可以大大縮短。

浪潮人工智能和高性能服務器產品部總經理劉軍表示:“新一代浪潮基因一體機可以更快更好地滿足處理客戶本地基因數據分析的需求,并提供更好的用戶體驗和出色的性能,從解決基因分析的效率問題入手,進一步加速精準醫療的發展?!眅ndprint

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