中國熱帶農業科學院生物所自主研發規?；蚪M大數據平臺

由中國熱帶農業科學院生物所自主開發的AFSM（基因組隨機擴增序列SNP多態性及甲基化多態性）技術， 結合大數據分析優勢， 打造了熱帶作物基因大數據平臺， 可大規模、低成本地構建遺傳連鎖圖譜， 開展GWAS分析、演化分析、指紋圖譜以及高通量甲基化分析等， 在建立熱帶特色作物分子標記育種平臺方面發揮了重要作用， 有效提升了中國熱科院在該領域的國際影響力。

據AFSM技術研發者夏志強副研究員介紹， 目前以該平臺為橋梁， 生物所已與美國普渡大學、 美國加州大學戴維斯分校、 CIAT、 EMBRAPA、 福建農林大學、 海南大學等在內的10余家國內外研究機構、 高校建立合作， 覆蓋木薯、 橡膠樹、 小桐子、 胡椒、 可可、 茶樹、 柱花草、 澳洲堅果、 香蕉、 蘭花、 甘蔗、 土豆、 芭蕉芋、 薏仁、 節節麥等多種作物。

近年來， 生物所種質與基因資源研究室已在木薯、 橡膠樹、 小桐子等作物上運用該技術并發表代表性成果。 如對木薯群體展開全基因組關聯分析（GWAS）， 確定了36個農藝性狀關聯的關鍵基因;在橡膠連鎖圖譜研究方面， 構建了大約6 940個AFSM標記遺傳連鎖圖譜與多個重要產膠相關QTL基因（該物種首個超高密度SNP定位QTL）;開展了小桐子的遺傳連鎖圖譜構建和QTL定位研究， 開發了含有3 422個AFSM標記遺傳連鎖圖（該物種首個超高密度圖譜）， 13個果實產量重要QTL等。

僅2018年以來， 夏志強副研究員相關基因組大數據研究成果陸續發表在《Nucleic Acids Research》、 《Biotechnology for Biofuels》、 《Industrial Crops & Products》、 《Frontiers in Plant Science》等國際期刊上， 累計影響因子24.585。

（摘自中國熱帶農業科學院網， http：//www.catas.cn/， 2018-08-21）