登錄號
- 受棉鈴蟲誘導的棉花糖基轉移酶UGT基因家族的生物信息學及表達分析
物種來源及基因登錄號來自棉花的基因UGTG01(基因登錄號,KX398934)、UGTG02(基因登錄號,KX398935)、UGTGo4(基因登錄號,MN701073)、UGTGo6(基因登錄號,MN812721),UGTGo7(基因登錄號,MN820705);來自山芥的基因BvUGT1(基因登錄號,JQ29161)、BvUGT73C9(基因登錄號,JQ291612)、BvUGT73C10(基因登錄號,JQ291613)、BvUGT73C11(基因登錄號
新疆農業科學 2023年10期2023-11-10
- 云南省怒江州獨龍牛內阿米巴原蟲的感染情況調查
07/BEL(登錄號:GU437825)、中國的牛源Entamoebasp.MG107/BEL(登錄號:MT734309)、中國的牛源E.bovis(登錄號:MT734187)、冰島的鹿源E.bovis(登錄號:FN666252)、瑞典的羊源E.bovis(登錄號:FN666250)、瑞典的牛源E.bovis(登錄號:FN666249)、瑞典的鹿源Entamoebasp.RL1(登錄號:FN666253)、瑞典的牛源Entamoebasp.RL2(登錄號:
動物醫學進展 2023年10期2023-10-24
- 安徽省5株新型鵝星狀病毒的分離鑒定與遺傳進化分析
GenBank登錄號:MF772821),設計7對引物(表2),包含病毒的全基因組且相互重疊。引物委托南京擎科生物科技有限公司合成。表2 GAstV全基因測序引物的基本信息Table 2 Basic information of primers for genome sequencing of GAstV取上述分離到的GAstV各毒株的F3代病毒液進行RNA提取與反轉錄,其中,反轉錄引物使用各段測序引物的下游引物。利用設計的引物對各毒株的全基因組序列分段擴
浙江農業學報 2023年5期2023-06-09
- 基于NCBI核酸數據庫的田頭菇屬Agrocybe真菌系統發育探析
致；其次，不同登錄號的濕粘田頭菇A.erebia 單獨聚為一類，系統發育關系較為清晰，并與褐色田頭菇A.brunneola 一起歸為具幕田頭菇組Sect.Velatae；再次，平田頭菇A.pediades 與其環狀變種A.pediades Var.cinctula 和糞生變種A.pediades Var.fimicola 整體聚為一類，同歸為平田頭菇組（Sect.Pediades）；此外，硬田頭菇A.dura，沼生田頭菇A.paludosa 和模式種田頭菇
科技視界 2022年25期2022-12-30
- 腐生性鉤端螺旋體Potoc 菌株全基因組學分析
株（NCBI 登錄號：NC_010842.1、NC_010845.1和 NC_010846.1）進行比較基因組學分析，并與已發表致病性鉤體問號基因種 56601 菌株（NCBI 登錄號：NC_004342.2 和 NC_004343.2）、波氏基因種 56142 菌株（NCBI 登錄號：SRX673783）和中間型L.licerasiaeVAR010 菌株（NCBI 登錄號：NZ_AHOO00000000.2）基因組進行共有與特有的基因比較分析。同時將上述
中國醫藥生物技術 2022年6期2022-12-09
- 太行雞CCNB2基因剪接異構體的克隆鑒定及其在卵泡發育中的表達模式分析
GenBank登錄號：XM_015278893.2和XM_015278892.2)，利用Primer Premier 5.0軟件按照圖1設計CCNB2基因剪接異構體鑒定引物，引物序列為：CCNB2-F：5′-AAGATGAAAAGCAGTGGGA-3′；CCNB2-R：5′ -AAGACAGAGGACAGGGATAC-3′。引物由蘇州金唯智股份有限公司合成。圖1 CCNB2剪接異構體鑒定模式圖Fig.1 Schematic diagram of CCNB2
中國畜牧獸醫 2022年10期2022-10-20
- 長白豬Plin3、Plin5基因克隆及表達規律研究
apiens，登錄號：NP_001157661.1)、豬(Susscrofa，登錄號：NP_001026948.1)、家鼠(Musmusculus，登錄號：NP_080112.1)、斑馬魚(Daniorerio，登錄號：NP_001373243.1)、家犬(Canislupusfamiliaris，登錄號：XP_038284951.1)、家貓(Feliscatus，登錄號：XP_023106648.1)、山羊(Caprahircus，登錄號：NP_0012
核農學報 2022年9期2022-09-21
- 牦牛源BVDV非結構蛋白NS5A的原核表達及抗原表位分析
GenBank登錄號：KX170647)，利用Primer Premier 5.0軟件設計1對特異性檢測引物(BVDV NS5A-F:5′-CCCAAGCTTATGTCTGGGAA-3′，BVDV NS5A-R:5′-TATACAATGAAGCTAGGATCCGCG-3′)擴增NS5A基因,預期擴增片段大小為1 488 bp，下劃線部分分別為Hind Ⅲ和BamHⅠ的酶切位點。引物由金唯智生物有限公司合成。1.2.3 PCR擴增BVDVNS5A基因 利用反
中國畜牧獸醫 2022年8期2022-08-23
- 新疆阿克蘇地區部分豬場流行性腹瀉病毒的檢測與分析
GenBank登錄號：MN692793）的PEDV序列信息，設計PEDV M基因特異性片段鑒定的引物，由生工生物工程（上海）股份有限公司合成。引物序列為：上游引物5'-GGCGAATTCCGGT TCTATTCCCGTTGATG-3'，下游引物5'-GGCCTCG AGATGAAGCACTTTCTCACTAT-3'，預計擴增片段大小為663 bp。2.3 PCR擴增目的基因在PCR管中，加入cDNA 1 μL，上游引物和下游引物各0.5 μL，EasyTa
養豬 2022年4期2022-08-17
- 低緯高原甘蔗銹病病原菌鑒定及系統進化分析
GenBank登錄號見表1)提交NCBI網站進行BLAST同源性比較分析。結果表明：云南勐海海引1號4份甘蔗銹病病原的核苷酸序列(GenBank登錄號：KP201840～KP201843)與已報道的屈恩柄銹菌核苷酸序列(GenBank登錄號：GU058021)同源性在99.9%以上，表明該病原是屈恩柄銹菌(表1)；云南保山、臨滄、勐海、孟連、西盟、瀾滄和文山其他甘蔗品種上的53份甘蔗銹病病原核苷酸序列(GenBank登錄號：KP201824～KP20183
西南農業學報 2022年6期2022-08-06
- 芫荽NPR1-like家族全基因組鑒定及分析
NPR1～6的登錄號分別是At1g64280、At4g26120、At5g45110、At4g19660、At2g41370、At3g57130，水稻()OsNPR1～3和OsNPR5的登錄號分別是ABE11614、ABE11615、ABE11618、ABE11622，大麥()HvNPR1的登錄號是CAJ19095，二穗短柄草()BdNPR1的登錄號是XP_003564857，玉米()ZmNPR1的登錄號是NP_001354806，小麥()wNPR1的登錄
江蘇農業科學 2022年13期2022-07-29
- 雞miR-10b-5p生物信息學及組織表達分析
taurus，登錄號：MIMAT0003839）、家犬（Canisfamiliaris，登錄號：MIMAT0009837）、山羊（Caprahircus，登錄號：MIMAT0035913）、豚鼠（Caviaporcellus，登錄號：MIMAT0046847）、錦龜（Chrysemyspicta，登錄號：MIMAT0037627）、原鴿（Columbalivia，登錄號：MIMAT0038406）、灰倉鼠（Cricetulusgriseus，登錄號：MIM
中國畜牧獸醫 2022年4期2022-06-01
- LMTIA技術檢測HPV核酸的可行性研究
中HPV16(登錄號：FJ006723)、HPV18(登錄號：AY262282)、HPV35(登錄號：HQ537722)、HPV39(登錄號：KC470249)、HPV45(登錄號：EF202162)、HPV51(登錄號：KU298904)、HPV52(登錄號：AB819274)、HPV56(登錄號：EF177181)和HPV58(登錄號：AB819276)的基因組，通過BLAST在線比對軟件選取保守序列，并使用Oligo 7軟件(美國Molecular
許昌學院學報 2022年2期2022-04-15
- 烏藥matK基因的生物信息學及多樣性分析
nzoin），登錄號：MG220997.1；香葉樹（Lindera communis），登錄號：AF244405.1；綠葉甘植（Lindera fruticosa），登錄 號：AF244405.1；黑殼 楠（Lindera megaphylla），登錄號：AF244404.1；滇粵山胡椒（Lindera metcalfiana），登錄號：AF244403.1；三椏烏藥（Lindera obtusiloba），登錄號：AF244402.1；山橿（Linder
湖北農業科學 2022年6期2022-04-13
- 甘肅玉米鐮孢莖腐病病原菌種群多樣性分析
發現TW30(登錄號：MT827971)和ZY13-2(登錄號：MT879692)與變紅鐮孢(登錄號：JF270223、JF270200和GU116584)聚為一支；YJ8-1(登錄號：MT879693)和ZY7-1(登錄號：MT879694)與木賊鐮孢(KT213320、KT213319和KT213315)聚為一支；HHXHZ15-7(登錄號：MT879684)與布氏鐮孢(MK896870、MH582231和KX269078)聚為一支；HCSZ4-9(登
核農學報 2021年11期2022-01-04
- 基于傳統分類與ITS序列分析法對真菌的鑒定研究
Bank，獲得登錄號，選擇其中最短的擴增序列，以此長度為基本比對長度，在NCBI(National Center for Biotechnology Information）數據庫尋找登記序列中含有與12種真菌樣品序列相似度高的片段，通過BLAST工具和DNAMAN軟件對序列進行分析，截去兩側擴增差異較大的堿基對，使比對的序列大小幾乎一致，重新用Clustalx軟件進行完全比對，用MEGA7.0軟件采用鄰位相連法(N-J，neighbor-joining）
食用菌 2021年6期2021-12-30
- 俄藏西夏文獻《天盛改舊新定律令》未刊情況概述
盛律令》內容的登錄號有：инв.№113、114、152—154、156—169、170c、171a、171г、173—180、180a、181—188、194—200、200a、201—204、219、710、713、785—787、789、2325—2332、2558、2569—2608、3810、4054、4180a、4180б、4181、4182、4184、4188、4429、4432、4542、4552、5040、5451、5793、6105、6
西夏研究 2021年4期2021-11-25
- 豬IGFBP3基因生物信息學分析
mRNA序列(登錄號:NM001005156)及其編碼的蛋白質序列(登錄號:NP001005156)。同時，下載其它種屬黃牛(登錄號:NP_776981)、水牛(登錄號:XP_006051369)、綿羊(登錄號:NP_001152748)、山羊(登錄號:NP_001301148)、貓(登錄號:XP_023105911)、狗(登錄號:XP_003639605)、小鼠(登錄號:NP_032369)、大鼠(登錄號:NP_036720)、雞(登錄號:NP_0010
安徽科技學院學報 2021年2期2021-08-24
- 云南新平蔗區發現甘蔗白條病
息：XP1S（登錄號MT625864）、XP2S（登錄號MT625865）、XP3S（登錄號MT625866）、XP4S（登錄號MT625867）、XP5S（登錄號MT625868）、XP6S（登錄號MT625869）、XP7S（登錄號MT625870）、XP8S（登錄號MT625871）。1.2 蔗汁總DNA提取將蔗莖表面用自來水清洗3 次去除表面污物，75%的酒精消毒20 s 后，用火將表面酒精燒盡，重復2 次進行表面消毒。把蔗莖切成長為5～8 cm
中國糖料 2021年3期2021-07-13
- 牛Bcl-2基因生物信息學功能預測分析
公布的抹香鯨（登錄號XM_007105114.3）、小鰛鯨（登錄號XM_007192009.1）、虎鯨（登錄號XM_004268067.2）、太平洋短吻海豚（登錄號XM_027118704.1）、長肢領航鯨（登錄號XM_030868121.1）、非洲野驢（登錄號XM_014843802.1）、山羊（登錄號KJ782301.1）、牦牛（登錄號MK050976.1）、北美野牛（登錄號XM_010854740.1）、印度牛（登錄號XM_019986619.1）、
黑龍江動物繁殖 2021年3期2021-07-12
- 重寄生擬盤多毛孢cr013菌株聚酮合酶基因的多樣性分析*
-1[17](登錄號：W3X7U2.1；A0A067XNI2.1)的PKS蛋白的KS保守結構域蛋白質序列為模板，對cr013菌株的基因組進行搜索，挖掘cr013菌株基因組中潛在的PKS基因，并利用Conversed Domain Database數據庫分析挖掘到的PKS蛋白的結構域。1.2.3 PKS蛋白的聚類分析從NCBI上下載已知功能的高度還原性PKS、部分還原PKS和非還原PKS的蛋白質序列作為參考序列，以此構建系統進化樹。通過Clustal W對挖
西部林業科學 2021年3期2021-06-24
- 參與調控意大利蜜蜂工蜂中腸基因表達的東方蜜蜂微孢子蟲miRNA的組學解析及其調控網絡
GenBank登錄號: XM_006564187.2, XM_006567501.2和XM_006558063.2等)；19條共有的顯著下調miRNA(novel-m0016-3p, let-7-x和miR-122-x等)靶向AmCK1vsAmT1和AmCK2vsAmT2中14條皆顯著上調的mRNA (GenBank登錄號: XM_016912123.1, XM_006558673.2和XM_016916036.1等)。NcCKvsNcT1中共63條特有的
昆蟲學報 2021年2期2021-04-13
- 青頭菌(Russula virescens)聚酮合酶基因的克隆及碳源對該基因表達的影響
GenBank登錄號MW307354)、β-tubulin(GenBank登錄號MW307355)和elongation factor 1α(GenBank登錄號：MW307356)鑒定后，該菌種為青頭菌(R.virescens)，并將該菌株命名為Rv-yaf-001.1.2 試劑與儀器真菌RNA提取試劑盒(康為世紀公司)，高保真DNA聚合酶(TaKaRa公司)，NanoDropTM2000紫外分光光度計(賽默飛世爾科技公司)，真菌總RNA提取試劑盒(Ta
福建農林大學學報（自然科學版） 2021年2期2021-04-08
- 基于DNA條形碼進行金花茶組種間鑒別
-tmH序列(登錄號：GQ 487336.1)、1個rpl 16序列(登錄號：GQ 487366.1)及2個trnl-trnF序列(登錄號：HQ 158589.1，GQ 487426.1)；金花茶： 1個psbA-tmH序列(登錄號：GQ 487354.1)、1個rpl 16序列(登錄號：GQ 487384.1)及1個trnl-trnF序列(登錄號：GQ 487444.1)；顯脈金花茶：1個psbA-tmH序列(登錄號：GQ 487339.1)、1個rpl
種子 2021年2期2021-03-31
- 20種中藥基原植物鯊烯合酶基因的生物信息學分析
Hoffm（登錄號AQV11962.1）、人參Panax ginsengC.A.Meyer（登錄號 ACV88718.1）、三七Panax notoginseng(Burkill) F.H.Chen ex C.H.（登錄號AIK21786.1）、西洋參Panax quinquefoliumL.（登錄號（AED99863.1）、竹節參Panax japonicas(T.Nees)C.A.Mey.（登錄號 ALB38664.1）、刺五加Acanthopana
中草藥 2021年3期2021-02-03
- 103個mcr質粒的結構與特征
0R(NCBI登錄號：KY689633)，達256 260 bp[20]；最小的是未命名的質粒unamed1(NCBI登錄號：KX528699)，為15 998 bp[21]。這些質粒至少可以劃分為7種不同的復制子類型，包括IncHI2、IncHI1A、IncN、IncFII、IncI2、IncX4、IncP1，與Wang等的報道一致[22]，其中IncI2占比最高，為50.5%；其次為IncX4，占比為24.3%。IncHI2類型的質粒較大，通常在200
浙江農業學報 2021年1期2021-01-28
- 棉花根際土壤真菌分離及黃萎病菌拮抗菌的篩選
99.83%（登錄號KX058045.1）、EF-1α序列與C.rosea菌株同源性為97.99%（登錄號MK752496.1）、β-tubulin序列與C.rosea菌株同源性為98.07%（登錄號KJ413352.1）、Actin序列與C.rosea菌株同源性為98.85%（登錄號MH102067.1）。分離獲得的B51菌，其ITS序列與粉紅粘帚霉C.rosea菌株的ITS序列同源性為99.82%（登錄號MT845995.1）、EF-1α序列與C.ro
塔里木大學學報 2020年4期2021-01-13
- 梅迪-維斯納病毒gag蛋白的原核表達及其交叉反應原性
GenBank登錄號為KT749881)后的陽性血清，均為本實驗室保存。1.1.3 引物設計與合成 以GenBank上登錄的MVV基因組gag基因序列(登錄號：NC001452.1)為參考序列，利用Oligo 7.0軟件設計上游引物gag-F：5′-CATGCCATGGCGAAGCAAGGCTCAAAGGAGA-3′(斜體為NcoⅠ酶切位點)、下游引物gag-R：5′-AAACTCGAGCAACATAGGGGGCGCGGACGGCA-3′(斜體為XhoⅠ酶
江蘇農業學報 2020年4期2020-09-10
- 銅綠假單胞菌遺傳演化分析
自日本的Pa（登錄號為NR_113599）關系最為親近，他們聚在一個次級分支上；分離菌株與來自美國的兩株Pa（登錄號為NR_117678與NR_114471）關系較親近，而與來自德國的Pa（登錄號為NR_026078）關系則較遠。銅綠假單胞菌；遺傳演化；基因樹；親緣關系銅綠假單胞菌，又稱綠膿桿菌，為革蘭陰性桿菌，該菌在1882年首先由Gersard氏從傷口膿液中分離到[1]。銅綠假單胞菌在環境中普遍存在，常見于正常人與動物腸道、皮膚上，也可在外傷、燒傷及尿
天津農學院學報 2020年2期2020-07-13
- 甘薯等20種作物蔗糖轉化酶抑制子生物信息學分析
基酸序列，序列登錄號分別如下：煙草(Nicotianatabacum)，登錄號：XP_016474343；辣椒(Capsicumannuum)，登錄號：XP_016551458；番茄(Solanumlycopersicum),登錄號：AGC75063；南方菟絲子(Cuscutaaustralis)，登錄號：RAL38588；馬鈴薯(Solanumtuberosum)，登錄號：AYV96510；小果咖啡(Coffeaarabica)，登錄號：XP_02711
西南農業學報 2020年4期2020-06-22
- 轉錄組分析揭示東方蜜蜂微孢子蟲侵染意大利蜜蜂的分子機制
GenBank登錄號: 36320842)作為內參基因，利用Primer Premier 5設計引物(表1)，委托福州擎科生物有限公司合成。利用RNA提取試劑盒(TaKaRa公司，大連)分別提取NcCK以及NcT1和NcT2中腸總RNA(熊翠玲等, 2019)，然后利用cDNA第1鏈合成試劑盒(Vazyme公司，南京)反轉錄成cDNA，作為模板進行qPCR，反應在QuantStudio 3(ThermoFisher公司，美國)上進行。qPCR反應按照SYB
昆蟲學報 2020年3期2020-05-22
- 豬圓環病毒3型河北株全基因組序列特征和遺傳進化分析
enBank(登錄號：MK105924).M：DL2000 DNA Marker；1：淋巴結組織；2：陰性對照.M：DL2000 DNA Marker；1：Lymph node tissue；2：Negative control.圖1 PCV3檢測結果Figure 1 PCV3 test resultsM：DL2000 DNA Marker；1： PCV3-1的PCR產物；2：陰性對照. M：DL2000 DNA Marker；1： PCR product
甘肅農業大學學報 2020年1期2020-04-14
- 浙貝母黑斑病致病菌的分離鑒定及分子檢測
k中鏈格孢菌（登錄號：MG182428）、細極鏈格孢菌（登錄號：MF356594）、蕓苔鏈格孢菌（登錄號：MG733697）等16條序列的同源性均為100%；與蔥鏈格孢菌（登錄號：KU293590）、蘋果鏈格孢菌（登錄號：KU293580）同源性為99.82%；與長柄鏈格孢菌（登錄號：MK675101）、鴨梨鏈格孢菌（登錄號：MK675102）、喬木交鏈孢菌 （登錄號：MK460966）、甘藍鏈格孢菌（登錄號：MK311298）同源性為99.64%。分離物
浙江中醫藥大學學報 2020年2期2020-04-01
- 基于28S rDNA部分序列的金沙江德澤段鯰寄生撒氏蟲屬(Thaparocleidus)單殖吸蟲的系統發育*
GenBank登錄號.基于BLAST(Basic Local Alignment Search Tool)選擇GenBank中同屬物種進行序列分析，用MEGA7.0[33-34]計算序列間轉換/顛換值，并基于雙參數模計算遺傳距離，以偽錨盤蟲屬(Pseudancylodiscoides)單殖吸蟲作為外群，通過最大似然法(maximum likelihood，ML)、鄰接法(neighbor-joining，NJ)和最大簡約法(maximum parsimon
云南師范大學學報（自然科學版） 2019年4期2019-07-30
- 含氟新農藥的研究進展
621，CAS登錄號為1360819-11-9，對霜霉病有著卓越的效果。Fluoxapiprolin為外消旋體，其R-體和S-體幾乎擁有同樣的生物活性。其分子結構與科迪華的氟噻唑吡乙酮（Oxathiapiprolin）非常相似，僅在吡唑環和苯環上有少許區別。氟噻唑吡乙酮作為一種全新作用機制的殺菌劑，年峰值將超過1.5億美元，因而Fluoxapiprolin的加入將使得該類產品的市場競爭變得逐漸激烈。1.2 IpflufenoquinIpflufenoqui
浙江化工 2019年5期2019-06-04
- 犬副流感病毒D121004株的分離鑒定及其F基因遺傳進化分析
（2007年，登錄號EF546392.1）核苷酸同源性最高，為99.5%，與我國的FA毒株（2007年，登錄號EF487542.1）核苷酸同源性為99.3%，與韓國的毒（CDV）、犬細小病毒（CPV）、CPIV的多重PCR方法。這些方法的特異性、靈敏性和重復性均較好，為CPIV的分離鑒定及流行病學調查奠定了基礎。CPIV具有凝集雞紅細胞的能力，與其他具有血凝性的病毒不同，它需要在4 ℃條件下進行。閆喜軍等[10]采用HA/HI試驗進行CPIV血清抗體流行病
中國動物檢疫 2019年2期2019-02-22
- 山葡萄苯丙氨酸解氨酶基因(PAL)的克隆與表達分析
GenBank登錄號：JN858963)同源性達到100%，認定該序列為山葡萄PAL基因的核苷酸序列。提交PAL的核苷酸序列，GenBank(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/)登錄號是MH045991。運用 DNAStar 軟件分析，該 DNA 序列具有完整的開放閱讀框 1 671 bp，3′-UTR 為 9 bp，5′-UTR 為85 bp，推斷它能編碼 556 個氨基酸。命名為VamPAL。圖2 VamPAL基因PCR電泳圖譜
華北農學報 2018年6期2019-01-09
- 新報道的農藥品種簡介
ol}，CAS登錄號：1314008-27-9。該劑為廣譜殺菌劑，對多種病害有效，預計2021年上市，預期年銷售額40億日元。Ipflufenoquin具有新穎作用機制，可用于防治對現有藥劑產生抗性的病原菌。1.3 MetyltetraproleMetyltetraprole是日本住友株式會社開發的苯基吡唑類、四唑類殺菌劑，開發代號S-2367?；瘜W名稱：1-[2-[[[1-(4-氯苯基)-1H-吡唑-3-基]氧基]甲基]-3-甲基苯基]-1,4-二氫-4
世界農藥 2018年6期2019-01-05
- 紅景天AG基因(RrAG)的電子克隆及生物信息學分析
南芥AG基因(登錄號：NP_001190766.1)序列作為參考序列，在中國國家基因數據庫的千種植物數據庫(https：//db.cngb.org/blast4onekp/blast)中通過選擇tBLASTn程序[Expectation Value(期望值，簡稱E值)使用SeqBuilder軟件分析可知，ZJUL-2061267基因全長為1 037 bp，含有789 bp的開放閱讀框，編碼262個氨基酸(圖1)。經NCBI網站CCD在線預測表明，該基因包含
江蘇農業科學 2018年21期2018-12-06
- 小反芻獸疫病毒F基因的序列分析
-F基因序列(登錄號：KF648287)，用Primer Premier 5軟件設計1對引物，其中上游引物(F-f)為：5′-ATGACACGGGTCGCAATCTTGA-3′；下游引物(F-r)為：5′-CTACAGTGATCTCACGTACGAC-3′。預期擴增的片段大小1 641 bp，引物由英濰捷基(上海)貿易有限公司合成，用dd H2O按10 pmol/μL稀釋，置-20℃保存備用。1.2.3 PPRV-F基因的RT-PCR擴增 以PPRV總RN
動物醫學進展 2018年11期2018-12-05
- Ⅰ群禽腺病毒hexon基因分型與序列分析
GenBank登錄號Z67970，FAdV-1型；SR48，GenBank登錄號EU979368，FAdV-2型；SR49，GenBank登錄號EU979369，FAdV-3型；ON1，GenBank登錄號GU188428，FAdV-4型；340，GenBank登錄號AF508952，FAdV-5型；CR119，GenBank登錄號EU979372，FAdV-6型；YR36，GenBank登錄號EU979373，FAdV-7型；TR59，GenBank登錄
動物醫學進展 2018年10期2018-11-02
- 關嶺自治縣某牛場蜱蟲病分子診斷及驅蟲試驗
rsicus，登錄號：KJ133607)，以微小牛蜱(Boophilus microplus，登錄號：BMU97713)、外翻扇頭蜱(Rhipicephalus evertsi，登錄號：DQ849265)、環形牛蜱(Boophilus annulatus，登錄號：JQ412126)、消色牛蜱(Boophilus decoloratus，登錄號：BDU97716)、囊形扇頭蜱(Rhipicephalus bursa，登錄號：KM986320)、血紅扇頭蜱(R
畜牧獸醫雜志 2018年5期2018-10-24
- 奧地利發現與仔豬先天性震顫相關的新型瘟病毒（Linda病毒）
enBank（登錄號KY436034），其長度為12 614 bp，具有381 bp的5'-非翻譯區，11 772 bp的開放閱讀框和461 bp的3'-非翻譯區。利用CLC Workbench 7.6對LV進行系統發育分析，發現LV與APPV之間的相似性僅有60%，與BV之間的相似性為68%。LV與BV氨基酸序列相似性為69%，與其他瘟病毒的氨基酸相似性＜54%。LV中含有所有已知的NS3蛋白酶裂解位點；位于典型豬瘟病毒的L/A、BV的L/S位點上的NS
豬業科學 2018年1期2018-03-07
- 口蹄疫病毒基因組3' 末端序列擴增及分析
GenBank登錄號：EF552696)，在病毒全基因組3'端設計1對引物及3'RACE引物，由新疆昆泰銳生物技術有限公司合成。表1表1 3'端序列擴增引物 Table 1 Primers for amplification of the 3'-end sequences引物Primer位置Position序列Sequence(5'→3')Poly(A)長度The length of Poly(A)1F7 987TCTGGACCTGACGAGTACCG1R
新疆農業科學 2018年11期2018-02-25
- 葡萄Actin基因家族的鑒定及進化和表達分析
化范圍較小。除登錄號GSVIVG01008254001和GSVIVG01014035001的基因外，其他14個基因的GC含量均低于其CDS的GC含量。除登錄號GSVIVG01008254001的基因外，其他15個基因編碼的蛋白質的理論相對分子質量為12 534.54～82 612.33，理論等電點為pI 4.92～pI 9.13。16個基因編碼蛋白質的消光系數為14 105～73 645，脂肪族氨基酸指數為65.54～92.06，其中9個為穩定蛋白，7個為
植物資源與環境學報 2017年3期2017-10-12
- 電子版館藏數據回溯中的交叉、重疊、阻滯問題處理
明問題下面將以登錄號為例）例：一批登錄號為五位“00100至00199”，另一批登錄號為六位“000100至000199”，五位字符和六位字符本身并不沖突；但由于集成管理系統中的“數據庫”在“館藏信息表”中，“登錄號”字段的屬性設定是“定長”即固定位數（長度一般為8或10）這樣導入的兩批“登錄號”就都變成了八位（以長度8位為例）“00000100至00000199”這樣就由于不同位數“數據”的交叉而造成了數據的重疊沖突。二是期刊和圖書數據導入新數據庫系統中
辦公室業務 2016年19期2016-11-25
- 卡拉干斯齒線蟲的形態及ITS和COⅠ序列分析
k數據庫，獲得登錄號為KT984870。ITS序列總長853 bp，其中ITS1長369 bp，5.8 S長153 bp，ITS2長331 bp； ITS1區的GC含量(47.2%)明顯高于ITS2區(40.7%)(圖2)。在GenBank檢索中，尚未發現卡拉干斯齒線蟲或斯齒屬內其他蟲種的序列。經過Blast同源比對，與伊氏雙齒口線蟲(Bidentostomumivashkini)(登錄號：KP693440)的同源性最高，達到94%；而與杯冠屬內小杯杯冠線
動物醫學進展 2016年10期2016-10-20
- 花生長鏈?；o酶A合成酶6基因(LACS6)的克隆、鑒定與組織表達
GenBank登錄號：KU301860)，分析該基因的結構組成，預測編碼氨基酸與其他植物的同源性，采用Real-Time PCR技術對LACS6的組織表達進行研究。結果顯示，花生LACS6基因全長2 116 bp，包含2 088 bp的ORF，編碼695個氨基酸，有23個外顯子和22個內含子。氨基酸序列比對顯示花生LACS6有真核生物?；o酶A合成酶保守結構域，并含有保守的激活位點和綁定位點。同源性分析發現花生LACS6與鷹嘴豆、綠豆、大豆、梅等13種物種
福建農業學報 2016年11期2016-02-13
- 三葉青兩個肌動蛋白基因片段的克隆及其分析
GenBank登錄號AM465189.1）、黃褐棉（GenBank登錄號JF722026.1）和陸地棉（GenBank登錄號JF722036.1）等的相似性分別為92%、85%和85%，其編碼的蛋白質與刺兒菜（GenBank 登錄號AEY77415.1）、月季（GenBank 登錄號BAF36000.1）和覆盆子（GenBank登錄號AED89635.1）等的相似性均為87%.而Th Act2核苷酸序列與葡萄（GenBank登錄號XM＿002265440.
杭州師范大學學報(自然科學版) 2015年4期2015-03-20
- 黃顙魚生長抑素基因的克隆及表達譜分析
(瓦氏黃顙魚，登錄號HQ830200；斑點叉尾鮰，登錄號NM_001200330)的SS基因cDNA序列，在其保守區內采用Primer 5.0設計引物S1，用于擴增黃顙魚SS基因中間保守區序列。根據獲得的黃顙魚SS基因中間保守區序列，設計 5′ RACE 和3′ RACE特異性引物S2和S3，其中S2用于擴增SS基因的5′端序列，S3用于擴增SS基因的3′端序列。將擴增的保守區序列、5′端和3′端序列進行拼接得到黃顙魚SS基因的cDNA序列全長。根據克隆的
西北農林科技大學學報（自然科學版） 2015年3期2015-02-24
- 安徽省豬流行性腹瀉病毒的ORF3基因序列分析
GenBank登錄號AF353511)的基因序列設計一對引物用于擴增ORF3基因。引物由上海生物工程有限公司合成。上游引物：5′-TCCTAGACTTCAA-CCTTACG-3′，下游引物：5′-GGTGACAAGTGAA-GCACAGA-3′。預期擴增的基因片段約為810 bp。1.4 ORF3基因的擴增取一無菌離心管，加入冷凍保存備用的病毒液100 μL，按總RNA提取試劑盒說明書步驟提取RNA，用1.3的下游引物作為反轉錄的引物，將RNA反轉錄為cD
西北農林科技大學學報（自然科學版） 2015年2期2015-02-21
- 大黃魚cyclin B 1和cdc 2 cDNA序列特征及組織表達分析
en－Bank登錄號FJ195327），如圖1.其中，編碼區（ORF）長度為1 194bp，可編碼397個氨基酸的蛋白.5′－非翻譯區（UTR）長度為63bp；3′－UTR的長度為580bp（去除poly A），含有2個加尾信號（AUUAAA），和4個多聚腺苷酸化元件（cytoplasmic polyadenylation elements，簡稱為 CPEs；A／UUUUUAU／A）.推導的LC－CB1蛋白預測分子質量約為44.56ku，等電點約為8.76
廈門大學學報（自然科學版） 2014年1期2014-12-01
- 星星草PtGAPDH基因的克隆與表達分析
eneBank登錄號GW405820)，設計2條3′RACE上游引物GSP3′1和GSP3′2，然后以RACE cDNA庫為模板進行巢式PCR擴增。第一輪PCR反應引物采用GSP3′1及AP1，反應程序為94℃ 2 min；94℃ 30 s，68℃ 30 s，72℃ 2 min，35個循環；72℃，7 min。第二輪PCR反應引物采用GSP3′2及AP2，反應程序為94℃ 2 min；94℃ 30 s，57℃ 30 s，72℃ 1.5 min，35個循環；
草業學報 2014年2期2014-11-07
- 斑點叉尾源維氏氣單胞菌對四環素類抗生素的耐藥性及耐藥基因的檢測
GenBank登錄號: 51492513)中的tetA基因, 大腸桿菌O69 (Escherichia coli serotype O69)質粒介導的tetA基因(GeneBank登錄號: 227434002)、大腸桿菌Q19中的tetA基因(GeneBank登錄號: 393195318)、肺炎克雷伯菌(Klebsiella pneumoniae)pKPI-6質粒(GenBank登錄號:394557614)中的tetA基因、蠟樣芽胞桿菌(Bacillus
水生生物學報 2014年2期2014-11-05
- 泰勒焦蟲表面抗原TaSP、spag-1和Tams1基因片段克隆與序列分析
源性最高的蟲株登錄號分別為FJ895154和AF214797的泰勒焦蟲株，同源性分別高達100%與99.69%；與spag-1基因片段同源性最高的蟲株登錄號為X78188、XM949884和M63017，它們之間同源性為100%。泰勒焦蟲；TaSP；spag-1；Tams1；克??；序列分析泰勒焦蟲病是蜱傳性血液原蟲病。泰勒焦蟲（Thei1eria annu1ata，T.annu1ata）表面抗原有子孢子表面抗原 （The sporozoite antige
草食家畜 2014年2期2014-06-05
- 四種隱孢子蟲半胱氨酸蛋白酶Cryptopain-1基因的克隆和序列分析
及其前體序列（登錄號：AF091366）；2004年，Abrahamsen等[15]通過對微小隱孢子蟲Iowa Ⅱ分離株的全基因組序列進行測定，報道了微小隱孢子蟲CP基因序列（GenBank登錄號：XM_627814）；2009年，Na等[16]設計引物，以微小隱孢子蟲DNA為模板成功擴增了該基因，將其標記為Cryptopain-1基因，并進行了克隆表達，采用免疫熒光技術對其在微小隱孢子蟲子孢子上的定位進行了分析，發現Cryptopain-1在微小隱孢子蟲
中國動物傳染病學報 2014年5期2014-04-13
- 豬源附紅細胞體rnpB基因的克隆與序列比較
pB基因序列（登錄號：EF523602）進行分析和比對，利用MEGA5.0軟件構建系統發育樹，并與16S rRNA判定結果進行比較。結果共得到42條豬附紅細胞體rnpB基因和11條小附紅細胞體（M. parvum）rnpB基因序列。豬附紅細胞體上海分離株rnpB基因與GenBank登錄的豬附紅細胞體德國分離株rnpB基因之間的核苷酸序列相似性為98.1%～100.0%；小附紅細胞體上海分離株rnpB基因與豬附紅細胞體德國分離株rnpB基因序列的相似性為91
中國動物傳染病學報 2014年3期2014-04-13
- 花生蘋果酸脫氫酶基因的克隆及其蛋白序列分析
Genbank登錄號為KF499119，該基因編碼區長度為1071bp，編碼356個氨基酸。序列比對結果表明，AhMDH編碼蛋白與大豆、蒺藜苜蓿和豌豆等具有較高的相似性?；ㄉ?；蘋果酸脫氫酶；克??；序列分析0 引言蘋果酸脫氫酶（malate dehydrogenase，MDH，EC 1.1.1.37），廣泛存在于動、植物和微生物中，可以催化草酰乙酸與蘋果酸之間的可逆轉換。MDH可催化草酰乙酸生成蘋果酸，使NAD+生成NADH，為硝酸還原過程提供還原力［1］；
臺州學院學報 2014年6期2014-02-24
- 新疆巴州牦牛種群線粒體DNA遺傳多樣性及其系統發育分析
GenBank登錄號NC＿006853）設計引物用于Cyt b基因全序列擴增。上、下 游 引 物 分 別 為：P1 5′-CCATAAATAGGT GAAGGTTTGG-3＇和P2 5′-TTGATGGTGAGAC TGCAGTT-3′。引物委托上海生工生物工程有限公司合成。PCR擴增體系為50μL體積，包括10×Buffer 5μL，25mmol／L MgCl24μL，2.5 mmol／L d NTPs 4μL，10 pmol／μL 上、下游引物各1μL
家畜生態學報 2013年8期2013-01-07
- 黃鱔IRF-1和IRF-2保守序列的克隆與表達
BI上的鱖 （登錄號為 AY647431.1）、大黃魚 （Larimichthyscrocea，登錄號為GU175707.2）、斜帶石斑魚 （Epinepheluscoioides，登錄號為 GU988700.1）和大西洋鮭 （Salmosalar，登錄號為CBL58209.1）IRF-1cDNA序列的保守部分設計簡并引物IRF-1-F1和IRF-1-R1，擴增黃鱔IRF-1cDNA的中間序列 （登錄號為JN695589）（表1）；根據NCBI上的牙鲆 （
長江大學學報(自科版) 2011年36期2011-04-08