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DNA 檢測技術分析血跡陳舊度的初探*

2024-01-12 13:25李海霞李晨華李學剛
廣東公安科技 2023年4期
關鍵詞:峰高檢材磁珠

李海霞 彭 穎 李晨華 李學剛

(廣東警官學院刑事技術系,廣東 廣州 510440)

利用DNA 分析技術檢測陳舊血跡的DNA,通過DNA 的數量和質量分析,了解血跡DNA 的降解過程,目前研究主要集中于不同載體對DNA 降解的影響及存儲DNA 的狀態效果[1-2]。其中,A.L. Rahikainen 等利用存儲16 年的FTA 血卡研究DNA 的質量變化,評估依賴于時間的降解情況,從1998 年到2013 年的8 個時間點隨機采集了4 個FTA 樣本,采用Quantifiler?Human Plus (HP)定量試劑盒測定提取DNA 樣品的數量和質量,證明FTA 卡存儲效果較明顯,DNA 較為穩定。然而國內外關于利用DNA 檢測技術判斷血跡陳舊度的研究較為鮮見。

本研究通過直擴法、Chelex-100 提取法、磁珠提取法等DNA 檢測方法對陳舊血跡進行DNA 質與量檢測,比較分析各自圖譜的均衡性,峰值、峰面積的差異性等,得出利用DNA 檢測技術對血跡陳舊度的初步探索。

1 材料與方法

1.1 材料

收集2009 ~ 2018 年每年度各2 份血濾紙檢材,共20 份血濾紙檢材,均為本鑒定中心日常檢案的檢材。

1.2 方法

根據《法庭科學DNA實驗室檢驗規范》(GA/T383-2014)標準,通過直擴法、Chelex-100 提取法、磁珠提取法等3 種不同的DNA 分析方法對陳舊的血濾紙進行檢測。采用1.2mm 打孔器對20 份血濾紙檢材進行取樣,其中,直擴法取1 片血濾紙,Chelex-100 提取法與磁珠提取法取3 片血濾紙,同時,加入10%的Chelex-100懸液為30μL,磁珠提取法的洗脫液亦為30μL,其余步驟按照試劑說明書進行規范操作提取DNA。采用GoldeneyeTM DNA 身份鑒定系統 20A 試劑盒(基點認知,北京,簡稱20A)進行擴增,2 種方法均為全模板擴增,即加入3.84μL 的DNA 提取液,擴增熱循環數為30 個循環,其余步驟按照商業試劑盒說明書進行操作。采用ABI-3130 遺傳分析儀進行電泳分離和基因分型。利用GeneMapper?ID V2.0 軟件進行分型結果的分析。

2 結果

因血濾紙檢材的放置年份長久,取樣面積并不多,為了確?;蚍中偷臏蚀_性,每個血濾紙檢材所得基因分型均與之前檢案的圖譜進行比較,血濾紙檢測所得圖譜(見圖1 ~圖2)。從不同年份圖中的峰高值和峰面積值可以看出,血濾紙存在降解趨勢,年份越久降解趨勢越明顯。按照265bp 作為大小片段的分界線,將各個基因座分為小片段基因座和大片段基因座,即小片段基因座包含D19S433、D5S818、D21S11、D3S1358、D13S317、D7S820、AMEL、vWA、D8S1179、TH01、D12S391 和D2S1338,大片段基因座包含D18S51、D6S1043、D16S539、CSF1PO、Penta D、TPOX、Penta E 和FGA,3 種方法的大小片段的峰高值和峰面積值(見表1 ~表3)。從表1 可以看出,無論是大片段還是小片段,直擴法的峰高值和峰面積值是最高的,其次是磁珠提取法,最低是Chelex-100 提取法。不同年份的大小片段峰高值和峰面積值的比值(見表4),從表2 可以得出,直擴法、Chelex-100提取法和磁珠提取法的峰高比值分別為3.24、4.13、3.31,同理,峰面積比值分別為2.81、3.57、2.81,直擴法和磁珠提取法的峰高和峰面積比值相當,而Chelex-100 提取法的峰高和峰面積比值差異大些。

圖1 檢材編號為1 的圖譜

圖2 檢材編號為18 的圖譜

表1 不同年份檢材直擴法的峰高和峰面積(單位:千)

表2 不同年份檢材Chelex-100 提取法的峰高和峰面積(單位:千)

表3 不同年份檢材磁珠提取法的峰高和峰面積(單位:千)

表4 不同年份的大小片段峰高值和峰面積值的比值

3 結論

直擴法、Chelex-100 提取法和磁珠提取法是目前最為常用的DNA 提取法。直擴法可以達到簡化實驗步驟,縮短檢驗時間、減少污染、節約檢材和成本的效果,但是對于雜質較多或降解較為嚴重的檢材,直擴法不一定是最佳選擇[3-4];Chelex-100 提取法可以做到DNA 量無損失,對于污染輕、雜質少的接觸DNA 檢材用此法提取出的DNA 片段更加完整,但在實驗過程中,Chelex-100 法卻不能有效地排除DNA 混有的雜質和降解的DNA 碎片的干擾[5];磁珠提取法可有效去除檢材中的雜質,提高DNA 的質量,并在降解和腐敗檢材上的處理略勝一籌,但在去除雜質的同時,會對DNA 存在的量造成一定的損失,對于微量檢材是不利的[6]。3 種不同的DNA 檢測方法存在各自的優缺點,根據不同條件的檢材選擇合適的DNA 檢測方法進行分析。

本研究通過3 種不同的方法分析血跡陳舊度,從圖譜可以看出,與大片段的峰高值和峰面積相比,小片段均高些,而且越久年份的血濾紙降解程度越明顯,從而說明用DNA 檢測方法去分析血跡陳舊度是可行的,圖譜結果可以明顯得出結論。

從檢測結果的均衡性、峰高比值和峰面積比值來看,直擴法對于2009 ~ 2018 年血濾紙檢材的檢測,在同等條件之下,較其他兩種方法,其檢測的峰高值和峰面積是最高的,檢測效果是最好的,長達14 年的血濾紙依然能檢測出較為完整的圖譜。假設3 片血濾紙的DNA 含量為100%,直擴法1 片血濾紙的DNA 含量為33%,而Chelex-100 提取法和磁珠提取法僅為12.8%,排除其他因素的影響,DNA 含量的不同直接影響圖譜的結果。因檢材量有限,未能做到DNA 含量精準相同,若檢材條件允許的情況下,可進一步研究。

從血濾紙的保存年份進行分析發現,普遍是年份越久的,峰高和峰面積的均值越大,比值亦越大。同時,亦發現2011 年和2012 年度的血濾紙檢材與這個結論不符,無論哪種DNA檢測方法,這4 個檢材的峰高和峰面積的比值均變化較大,是檢測保存條件的問題還是提供血液的個體差異問題,原因仍需進一步探討。

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