錯義
- 利用AlphaMissense準確預測蛋白質組的錯義突變
觀察到的絕大多數錯義突變具有未知的臨床意義。研究人員開發了AlphaMissense，這是一種基于AlphaFold的新AI模型，它在人類和靈長類物種變異群體頻率數據庫上進行了微調，用于預測錯義突變的致病性。通過結合結構背景和進化保守性，AlphaMissense在廣泛的遺傳和實驗性基準測試中實現了最先進的預測，而且完全沒有明確地在此類數據上進行過訓練?；虻钠骄虏⌒苑謹狄部梢灶A測其細胞的重要性，能夠識別現有統計方法不足以檢測的短的必需基因。作為一種研究
廣東藥科大學學報 2023年5期2023-12-30
- 新疆維吾爾自治區婦女宮頸感染人乳頭瘤病毒16型E4和L2的遺傳變異分析
酸變異,包括4種錯義變異和7種同義變異,其中錯義變異分別為:A2541C(1/72,1.39%)、G2621C(1/72,1.39%)、A2636C(3/72,4.17%)和T2703G(1/72,1.39%)。氨基酸改變分別為:蘇氨酸替換為脯氨酸(T25P)、谷氨酰胺替換為組氨酸(Q51H)、谷氨酸替換為天冬氨酸(E56D)、亮氨酸替換為纈氨酸(L79V)。常見同義變異為nt2520(T-C)(28/72,38.89%)、nt2546(C-T/A)(70
安徽醫科大學學報 2023年11期2023-12-12
- KCNQ2基因相關癲癇臨床表型與基因型相關性研究
變(無效突變)和錯義突變。無效突變是那些導致蛋白嚴重畸形并導致功能喪失和單倍功能不足的突變[8-9],包括截短突變(無義和框移)、經典剪接位點突變(標準±1或2)、起始密碼子突變或單/多外顯子缺失。癲癇表型的譜系潛在范圍從輕度癲癇如局灶性癲癇到嚴重的發育性癲癇性腦病。將癲癇的表型分為輕表型與重表型。輕表型包括肌陣攣癲癇、全面性癲癇、良性嬰兒性癲癇、良性新生兒癲癇、良性新生兒-嬰兒癲癇和早發型癲癇;重表型包括癲癇合并神經系統發育障礙、癲癇合并孤獨癥、發育性癲
河南醫學研究 2023年20期2023-11-08
- 新生兒高膽紅素血癥與UGT1A1基因突變的關系研究
共發現TATA 錯義突變47 例，觀察組35 例，對照組12 例，觀察組的TATA（TA）6/7 錯義突變基因分布、基因頻率均高于對照組，差異無統計學意義（P＞0.05）。見表2。在UGT1A1基因第1 外顯子區共發現P229Q 錯義突變8 例，其中觀察組7 例，對照組1 例，觀察組的P229Q（TA）6/7 錯義突變基因分布、基因頻率均高于對照組，差異無統計學意義（P＞0.05）。見表3。在UGT1A1基因1 外顯子區共發現G71R 錯義突變33 例，其
分子診斷與治療雜志 2023年9期2023-10-26
- MITF致病性突變與Waardenburg綜合征臨床表型相關性分析
變類型進行分類：錯義突變、無義突變、移碼突變、剪切突變、插入突變、缺失突變。表型描述：依據研究中描述的臨床表型進行描述以及分類。根據WS 表現出的主要臨床特征，大致分為三類，虹膜顏色改變（Heterochromia irides；Normal），皮膚色素異常改變，頭發顏色改變（Abnormality of the hair；Normal）。其中，進一步將皮膚色素異常分類，分為面部雀斑（Freckles），皮膚脫色素白斑(hypopigmentation)，
中華耳科學雜志 2023年2期2023-05-22
- 胃底腺來源腺癌的臨床病理學特征及基因分析
例顯示GNAS 錯義突變，其中1 例同時發生GNAS 錯義突變和NCOR2整碼插入變異，1 例同時發生GNAS、KMT2D 錯義突變；另有1 例顯示ZFHX3 整碼缺失、KRAS、HRAS、PIK3CA 錯義突變，1 例顯示HRAS、TP53 錯義突變。1 例GA-FGM 顯示BRAF、TP53、KMT2A、ATM 錯義突變。3 討論胃底腺型腺癌是一種罕見的低度異型性腺癌，發病率＜0.01%[3]。大多數無幽門螺桿菌感染，也可見于幽門螺桿菌根除治療后或少數
中國醫藥導報 2023年5期2023-03-21
- 染色體2q33.1 區域遺傳變異影響肺癌易感性機制研究
一個外顯子區域的錯義變異rs3769823（c.41A ＞ G,p.Lys14Arg）可引起caspase-8 的氨基酸序列改變，是潛在的致病性變異?；谏鲜鼋Y果，研究團隊運用分子生物學實驗，分別從體內、體外水平探究caspase-8 突變型（caspase-8K14R）對肺癌細胞功能的影響，發現caspase-8K14R 對TRAIL 相關凋亡信號通路具有調控作用。該研究探討了錯義變異rs3769823 在肺癌發生中的作用，并闡明其影響肺癌發生的生物學機
中國腫瘤臨床 2022年23期2022-12-29
- 11 例原發性腎性糖尿患兒SLC5A2 基因變異分析
異，其中有10種錯義變異、1種缺失變異、3種剪接變異（表1）。ACMG指南進行變異蛋白的致病性預測，結果均為VVS（臨床意義未明）。見表2。表1 11例PRG患兒臨床資料及SLC5A2基因變異分析表2 ACMG指南進行變異蛋白的致病性預測錯義變異中，c.655G>A（p.A219T）、c.736C>T（p.P246S）、c.1540C>T（p.P514S）為前期文獻已報道的致病變異，其余c.482C>T（p.S161F）、c.505G>A（p.A 169
臨床兒科雜志 2022年12期2022-12-28
- 不同棲息環境的兩種嚙齒動物Vkorc1基因多態性
20.0對不同錯義突變位點的分布頻數進行χ2檢驗，比較錯義突變位點在不同縣(市、區)的差異，P＜0.05為差異有統計學意義。2 結果2.1 捕獲率及樣本占比本研究共在山西省的18個縣(市、區)捕獲嚙齒動物613只(表3)。在農田和果園中，共捕獲511只嚙齒動物(未捕獲到黃胸鼠)，LIS捕獲率最低(6.85%)，XIX最高(14.77%)；在養殖場共捕獲102只家棲類嚙齒動物，HNY捕獲率最低(0.37%)，LIC最高(7.22%)(表3)。經形態學標準和
獸類學報 2022年6期2022-12-19
- 抑癌基因TP53突變狀態與三陰性乳腺癌病人預后的研究
種突變類型，包括錯義突變、移碼突變、無義突變和剪切突變等[5]。既往研究中，TP53基因突變對于乳腺癌的生存預后影響不一[6]，尤其不同突變類型對于早期TNBC病人的預后影響尚不明確。本文旨在研究TNBC病人TP53基因體系突變的頻率和類型及其與臨床病理特征的關系，并對TP53突變與無復發生存（relapse-free survival,RFS）、生存（overall survival,OS）和遠處無復發生存（distant relapse-free su
外科理論與實踐 2022年5期2022-11-10
- 胃底腺型胃腫瘤11例分子遺傳學特征分析
S和2例KRAS錯義突變，其中2例同時發生GNAS、KRAS錯義突變(圖1)；2例FGFR錯義突變，1例TP53錯義突變，1例BRCA1錯義突變；1例APC、KRAS、NRAS、FGFR同義突變，1例MSH6、BRCA1同義突變；1例CDK4擴增，但拷貝數僅1.4，予以忽略。1例泌酸腺腺瘤未見GNAS、KRAS、TP53突變。11例均未檢出融合基因，且CTNNB1、BRAF、PIK3CA、HER-2、MLH1、MSH2、PMS2基因均未檢出變異(表1)。表
臨床與實驗病理學雜志 2022年9期2022-11-04
- ASPM基因缺陷致新生兒小頭畸形6例病例系列報告并文獻復習
探討失功能變異和錯義變異對發育遲緩的影響。計數資料采用卡方檢驗和Fisher確切概率法進行比較。P2 結果2.1 CNGP數據庫中ASPM基因P/LP變異攜帶頻率 圖1顯示，在HGMD和ClinVar數據庫收錄的ASPM基因致病變異分別為224個位點和203個位點。2個數據庫共同收錄155個位點；表1顯示，在CNGP數據庫中攜帶的ASPM基因復合雜合P/LP變異12個位點。12個P/LP變異均為失功能變異，其中無義變異4個、移碼變異7個、剪切位點變異1個。
中國循證兒科雜志 2022年4期2022-10-07
- 肝豆狀核變性家系ATP7B基因錯義和同義突變
發展，越來越多的錯義和同義突變被相繼報道，正確識別同義突變對疾病的早期診斷、治療及預防具有重要意義。最近,Wang等人[5]研究表明,同義突變c.4014T>A和錯義突變R919G，可導致ATP7B基因轉錄本中外顯子跳躍，形成截斷的蛋白質，進一步提高了對WD發病機制的認識。本研究分析了一例臨床診斷肝豆狀核變性患者，對先癥者及其家系內成員ATP7B基因進行了測序，探討突變位點的臨床意義，分析了致病基因在該家系的遺傳規律。1 資料與方法1.1 一般資料:選取2
寧夏醫學雜志 2022年5期2022-06-17
- 不明原因新生兒高膽紅素血癥與UGT1A1基因突變的關系*
入突變和G71R錯義突變，亞洲地區的黃種人常見為第1 外顯子區G71R 錯義突變為主[2-5]，歐美地區高加索人及Gilbert綜合征常見為啟動子區TATA盒插入突變為主[6-9]。本研究旨在探討不明原因新生兒高膽與UGT1A1基因編碼啟動子區TATA盒和第1外顯子區基因突變類型的關系，以便為明確不明原因新生兒高膽的病因及診治提供遺傳學依據。1 對象與方法1.1 研究對象選取2021 年1～12 月在廣西環江毛南族自治縣人民醫院新生兒科和產科住院的新生兒，
廣西醫科大學學報 2022年5期2022-06-07
- SLC6A1基因變異相關兒童癲5例病例系列報告
)，例3～5均為錯義變異，物種保守性分析顯示第460、362及550位氨基酸在不同物種間高度保守，分別用SIFT、PolyPhen-2、MutationTaster和PROVEAN軟件對這3種錯義變異進行蛋白功能預測，顯示均為有害變異。例2和3的基因變異位點均為尚未見報道的新變異位點。3 討論文獻復習及數據庫檢索顯示，目前報道98種SLC6A1基因變異，其中錯義變異最常見，其次為無義變異、剪接變異及片段缺失或插入，1例染色體易位。截短突變由于蛋白質翻譯提前
中國循證兒科雜志 2022年2期2022-05-26
- SLC6A1基因變異相關兒童癲5例病例系列報告
)，例3～5均為錯義變異，物種保守性分析顯示第460、362及550位氨基酸在不同物種間高度保守，分別用SIFT、PolyPhen-2、MutationTaster和PROVEAN軟件對這3種錯義變異進行蛋白功能預測，顯示均為有害變異。例2和3的基因變異位點均為尚未見報道的新變異位點。3 討論文獻復習及數據庫檢索顯示，目前報道98種SLC6A1基因變異，其中錯義變異最常見，其次為無義變異、剪接變異及片段缺失或插入，1例染色體易位。截短突變由于蛋白質翻譯提前
中國循證兒科雜志 2022年2期2022-05-26
- 略陽烏雞開產日齡遺傳參數估計和FSHR基因序列變異與開產日齡的關聯性分析
SHR基因內3個錯義突變與略陽烏雞開產日齡的關聯性，旨在定量評估遺傳效應對開產日齡的決定性及開產日齡與各時期產蛋數間的遺傳關系，篩選與開產日齡存在顯著關聯性的分子標記，為略陽烏雞開產日齡育種方案的制定和分子輔助育種方法的建立奠定理論基礎。1 材料與方法1.1 略陽烏雞的養殖和表型數據采集略陽烏雞作為一個地方品種，未受系統選育。該品種維持了較大的表型變異性和遺傳多態性，是開展經濟性狀QTL定位的理想群體。本研究所用樣本為略陽烏雞蛋用系二世代675只母雞。這些
中國農業大學學報 2022年6期2022-05-16
- 新型冠狀病毒(SARS-CoV-2)變異的研究進展
2的S蛋白中發生錯義突變，原來在614號位編碼天冬氨酸(D)的殘基突變為甘氨酸(G)。該突變株于2020年1月28日在德國巴伐利亞州的一次小規模疫情中首次被發現，隨后在歐洲流行，不斷擴散傳播到北美洲、大洋洲、南美洲和亞洲[3,14]。但有研究基于GISAID上共享的SARS-CoV-2基因組序列，回顧病毒樣本發現1月下旬在中國的廣州、四川和上海已經出現這種突變[14]。在2020年3月之前，D614G突變株僅占全球公布病毒株測序序列的不到10%，綜述3月，
中國人獸共患病學報 2022年2期2022-03-18
- 15例Wiskott-Aldrich綜合征患兒的臨床特點及基因突變分析
。最常見的類型為錯義突變(7例)，均位于外顯子1～4號，其中4例為XLT(WAS評分2分)，3例為典型WAS(WAS評分3分2例，4分1例)。8例非錯義突變位于外顯子5～11號，表現為剪接突變、缺失突變、無義突變等，臨床表型均為典型WAS(WAS評分4分4例，5分2例，3分2例)。典型WAS患者的比例，錯義突變組顯著低于非錯義突變組(42.8%vs100%,P=0.026)；WAS≥4分患者的比例，錯義突變組也顯著低于非錯義突變組(14.3%vs75%,P
福建醫科大學學報 2021年3期2021-11-15
- 中國漢族心肌病患者FLNC 基因變異的家系研究
了許多FLNC的錯義突變，DCM 及ACM 患者中發現的則多為截斷突變，這表明不同類型的FLNC突變可能存在不同的致病機制。然而中國漢族人群心肌病患者攜帶FLNC突變的變異譜仍不明確，其基因型-表型的關聯性也值得進一步探究和討論。資料和方法入組人群2018 年至2020 年就診于復旦大學附屬中山醫院的150 名無血緣關系的漢族HCM 患者和50 名DCM 患者被納入研究。成年人HCM 的臨床診斷標準與以往文獻一致：一個或多個左室心肌節段的最大室壁厚度≥15
復旦學報(醫學版) 2021年5期2021-10-13
- ADGRV1基因突變致常染色體不完全顯性遺傳癲癇1例并文獻復習
GRV1基因雜合錯義突變癲癇患者的臨床資料進行分析，對ADGRV1基因進行測序，同時與人類基因突變數據庫(HGMD)中其他攜帶ADGRV1基因突變的癲癇患者的突變信息、臨床表型相結合進行分析，以探討ADGRV1基因在癲癇中的致病性及致病規律。1 臨床資料患兒，男，14歲。8歲時開始頻繁出現點頭癥狀的肌陣攣性發作，發作時無意識障礙，多發生于激動或勞累后、晨起時，偶爾出現全面強直-陣攣性發作(GTCS)?；純赫J知功能和精神狀態均正常。腦電圖表現為彌漫性的棘-慢
精準醫學雜志 2021年4期2021-09-22
- 單倍型異基因造血干細胞移植治療PRF1基因突變成人原發性噬血細胞性淋巴組織細胞增多癥一例
T450M)純合錯義突變，且該突變與致病相關。追問其家族史，父母為近親結婚?；颊咚蜋zPRF1基因檢測，結果示純和錯義突變c.1349C>T，導致所編碼氨基酸發生突變(蘇氨酸突變為甲硫氨酸)?；颊吒改感谢驒z測也存在PRF1基因雜合錯義突變，且存在表達蛋白改變。而患者姐姐存在雜合同義突變，無表達蛋白改變(圖1)。最終診斷：原發性HLH。配型檢測提示其胞姐為HLA 5/10相合，后行單倍體異基因造血干細胞移植(allo-HSCT)。移植后檢測未發現PRF1基因
臨床內科雜志 2021年6期2021-08-19
- 鈉離子通道相關基因突變致兒童癲癇 17例的臨床特征及致病基因譜
變。其中 7例為錯義突變（c.5657G＞A、c.4633A＞G、c.5348C＞T、c.4216G＞C、c.1499G＞A、c.2837G＞A、c.3176A＞T），1例為移碼突變（c.3483delA）。3例（例2、4、7）攜帶變異為國際已報道變異（c.4633A＞G、c.5348C＞T、c.2837G＞A），余 5例為未報道的新突變。見表1。2.2.2 SCN1B 基因突變病兒臨床表型特點 1例SCN1B 基因突變病兒起病年齡為 7歲 3月齡，發作表
安徽醫藥 2021年6期2021-06-17
- 普通人群間隙連接蛋白β2基因編碼區突變分析▲
elAT；7種為錯義突變，包括良性變異4種(c.79G>A、c.341A>G、c.11G>A、c.608T>C)和致病性錯義變異3種(c.109G>A、c.557C>T、c.139G>T)。 各種變異體數量及其基因頻率見表2。表1 84例GJB2基因突變者的檢測結果 表2 GJB2基因突變位點及基因頻率3 討 論耳聾基因GJB2全長12513 bp，含2個外顯子，其中編碼序列全長681 bp，位于2號外顯子，僅有1個開放讀碼框。Sanger測序可以準確檢測
廣西醫學 2021年1期2021-03-18
- 結節性硬化癥伴癲癇發作患者基因突變類型與臨床表型相關性研究
(11.8%)、錯義突變16例(47.0%)。TSC2基因突變51例(60.0%)，分別為：剪切突變3例(5.9%)、移碼突變19例(37.3%)、無義突變1例(1.9%)、錯義突變25例(49.0%)及大片段缺失3例(5.9%)。上述不同突變類型在TSC1及TSC2基因分布中無統計學差異(χ2=6.575，P=0.160)，但可見TSC1及TSC2基因均以移碼突變及錯義突變的突變率較高(見表1)。表1 TSC1/TSC2基因突變類型2.3 TSC1/TS
中風與神經疾病雜志 2020年9期2020-10-15
- 飼喂動物油脂對鴨FMO3基因不同基因型表達水平的影響
究表示FMO3的錯義突變發生在第二外顯子、第六外顯子和第七外顯子.所以本研究根據NCBI上北京鴨FMO3的基因序列設計引物(表1)，引物合成由北京擎科生物技術有限責任公司進行.運用PCR技術擴增FMO3第二、第六和第七外顯子，將PCR產物送測序公司進行測序.采用MEGA6軟件對不同個體測序片段進行序列比對，并結合MEGA6軟件對差異堿基測序圖進行比較分析，去除可能存在的誤判，確定突變位點基因型，計算基因型頻率和基因頻率.表1 鴨FMO3基因錯義突變檢測引物
甘肅農業大學學報 2020年3期2020-07-21
- SCN1A基因突變類型與Dravet綜合征患兒臨床特征的相關性
變類型主要表現為錯義突變、截斷突變(剪切突變、無義突變、大片段缺失/重復、移碼突變),而錯義突變多集中在門孔區(S5-S6)、電壓感受區(S4)[5]。相關研究指出,臨床對SCN1A突變類型的識別已超過1 200種,其中>900種突變類型和DS發病有關,但針對SCN1A突變類型和DS臨床特征是否有關仍缺乏報道[6]?；诖?本研究對SCN1A基因突變類型與Dravet綜合征(DS)患兒臨床特征的相關性進行分析,以指導臨床早期識別和診治。1 資料與方法1.1
山西醫科大學學報 2020年6期2020-07-14
- 一個中國Usher綜合征2型家系中USH2A基因的2個新的致病突變
中的A。1.3 錯義突變異致病性預測及分析使用了幾種不同的計算機軟件，如SIFT和PROVEAN(http:∥provean.jcvi.org/genome_submit_2.php)、PolyPhen-2(http:∥genetics.bwh.harvard.edu/pph2/)和MutationTaster(http:∥www.mutationtaster.org/)來預測錯義變體的致病作用。使用Clustal Omega(https:∥www.ebi
同濟大學學報（醫學版） 2020年3期2020-06-26
- 著色性干皮病兩例ERCC2和ERCC5基因突變分析
r 軟件對2 個錯義突變c.1805G＞A 和c.2453C＞T 進行功能預測，均分別為“有害”、“很可能損害”和“致病性”，顯示其可能致病。Mutation Taster 軟件對無義突變c.586C＞T 預測為“致病性”，可產生截短蛋白，影響蛋白功能。PolyPhen?2軟件顯示分析c.1805G＞A、c.2453C＞T 及c.586C＞T 突變所在位點均在不同物種間高度保守。表1 ERCC2和ERCC5基因Sanger測序引物序列圖3 例1著色性干皮病
中華皮膚科雜志 2020年4期2020-06-05
- 原發性開角型青光眼致病基因的篩查
ys) 該變異為錯義突變，即染色體位置Xp11，參考序列NM_017745.5，第15 外顯子，cDNA水平的第5003 位堿基C變成了堿基G，預計會使蛋白水平的第1668 位的氨基酸Ser變成了氨基酸Cys，發生了Ser1668Cys雜合突變；HGMD數據庫未見文獻報道，ESP6500siv2_ALL、千人基因組（1000 g 2015aug_ALL）和dbSNP147 數據庫均未見收錄。BCOR基因如發生病理性變異可引起小眼畸形綜合征，通常呈X連鎖顯性
安徽醫專學報 2020年1期2020-03-17
- p53 突變與結腸癌的研究進展
綁定結構域發生錯義突變時，p53 會突變成促癌基因。但值得注意的是，p53 突變成促癌基因有以下兩種方式，一種是錯義突變的過程中發生原有野生型p53 功能的缺失，另外一種錯義突變的發生增加了具有促癌功能的基因。近年來的臨床和基礎研究顯示，p53 的錯義突變在腫瘤的發生和發展的作用十分復雜，本文就近幾年來p53 突變（包括獲得致癌性突變和丟失野生型功能突變）在結腸癌中作用的臨床和基礎研究結果進行綜述。1 結腸癌的可能發生機制1.1 結腸癌與突變基因大部分的
岳陽職業技術學院學報 2020年2期2020-02-22
- Dubin-Johnson綜合征分子遺傳學研究進展
達68個，包括：錯義突變、無義突變、剪接突變、調節突變、刪除/缺失突變、插入突變、小插入-缺失突變、復雜重排突變，其中絕大多數是堿基置換突變導致的錯義突變和無義突變，見表1。表1 Dubin-Johnson綜合征編碼基因ABCC2突變類型續上表突變類型核苷酸改變突變位點蛋白質改變參考文獻錯義/無義c.298C>TExon.2p.R100*Shoda(2003)HepatolRes27:322Xiong(2015)Science347:1254806c.37
中國婦幼健康研究 2019年11期2019-12-06
- MKRN3基因與兒童中樞性性早熟
移碼突變，17個錯義突變和2個無義突變[6-7]。最近，劉璐等人在2個散發病例和5個家系病例中發現4種新的基因突變，分別為：c.1138G>A(p.Glu380Lys )、c.1420T>A (p.Leu474Met)、c.673C>G (p.Leu225Val)、c.1071C>G(p.Ile357Met)[5](詳見表二)Macedo D對健康和中樞性早熟女孩進行甲基質譜分析，也發現在CPP患者啟動子區域的4個罕見突變4-nt deletion (c.
中南醫學科學雜志 2019年6期2019-12-05
- 兩種錯義突變p.Glu502Lys和p.Gly542Ser所致遺傳性Ⅻ缺陷癥家系的分析
lu502Lys錯義突變，同時在14號外顯子均存在c.1681 G＞A雜合突變，導致p.Gly542Ser錯義突變。家系分析表明先證者父親及兒子為c.1561G＞A雜合突變，母親為c.1681 G＞A雜合突變。先證者及家系成員FⅫ基因第1外顯子啟動子區46C/T多態性位點基因型均為CT型?；驒z測結果見表2和圖1。表1 FⅫ缺陷癥家系凝血指標檢測結果Table 1 The coagulation indices of the hereditary coag
分子診斷與治療雜志 2019年2期2019-03-26
- 更正：堿基編輯系統研究進展
對小鼠基因引入了錯義突變，并將ABE7.10包裹到雙反式剪接的AAV病毒系統中，對基因進行了無義突變，建立了杜氏肌營養不良的小鼠疾病模型”現更正為“Jin-Soo Kim實驗室率先利用ABE7.10對小鼠基因引入了錯義突變，并將ABE7.10包裹到雙反式剪接的AAV病毒系統中，遞送到小鼠模型中進行無義突變的較正，成功治療了杜氏肌營養不良的小鼠疾病表型?！庇纱私o讀者帶來的不便，作者深表歉意！DOI: 10.16288/j.yczz.19-316
遺傳 2019年10期2019-03-02
- 科技
性狀耳大小的重要錯義突變，為進一步研究調控豬耳大小的分子機制提供了重要信息，并為豬品種遺傳資源多樣性研究提供了重要參考。相關研究成果在線發布在 《動物遺傳學（Animal Genetics）》上。我國擁有76個地方豬種，耳大小和形態具有豐富多樣性，耳大小已經成為了品種特異性標志之一。該團隊在豬5號染色體上定位了4個影響豬耳大小的關鍵候選基因，利用末端快速擴增技術得到基因的cDNA全長序列，其中WIF1基因在豬耳中的表達量最高。通過進一步研究，發現了位于編碼
中國飼料 2019年7期2019-01-10
- 基于機器學習開發的危害性預測軟件對罕見錯義突變的預測評估
AP主要針對罕見錯義突變的預測，為了公平評估，本文主要評測不同危害性預測軟件對罕見錯義突變的預測；在收集的致病突變位點中也發現錯義突變占了致病SNP位點的絕大部分。1 材料與方法1.1 致病位點和中性位點測試數據集收集兩份獨立測試數據集用于評測整合型突變危害性預測軟件的效果，測試集1：ClinVar數據集，致病和中性的突變位點來源于ClinVar數據庫[13，14](variant_summary.txt.gz文件，下載于ClinVar FTP，數據更新時
皖西學院學報 2018年5期2018-11-19
- 1例遺傳性凝血因子V缺乏癥家系的基因分析
基因存在1個雜合錯義突變G16088C(Asp68His)；8個單核苷酸多態性(SNP)位點突變，雜合錯義突變A38529G(Arg485Lys)，純合錯義突變A58668G(Met1736Val)、A45888G(Lys830Arg)、A45909G(His837Arg)、A46088G(Lys897Glu)、純合同義突變C45523T(Ile708Ile)、T45550C(Asn717Asn)、A45616G (Ser739Ser)；先證者妹妹的基因型
重慶醫學 2018年14期2018-06-20
- 中國134例黑色素瘤患者P16INK4a、CDK4和CCND1基因突變及其臨床意義
6INK4a基因錯義突變11例，突變率為8.2% (11/134)，其中肢端型、黏膜型黑色素瘤P16INK4a基因突變率分別為10.8% (4/37 ) , 8.0%(7/87)。經外周血淋巴細胞DNA重復上述測序證實，以上突變均不是遺傳性突變。局灶性黑色素瘤(Ⅰ-Ⅱ期)P16INK4a基因突變頻率為8.7%(4/46)，轉移性黑色素瘤(Ⅲ-Ⅳ期)P16INK4a基因突變頻率為8.0%(7/88)。P16INK4a的編碼序列覆蓋1α、2、3號外顯子，1α外
基礎醫學與臨床 2018年2期2018-01-29
- SFTPC突變致兒童間質性肺病伴家系外顯不全3例并文獻復習
)linker區錯義突變65例中有5例成人，其中3例成人家系均有家族史；3)BRICHOS區錯義突變27例中有6例成人；ILD：間質性肺??；CPI：嬰兒慢性間質性肺炎；CIP：慢性間質性肺炎；DIP：脫屑性間質性肺炎；NSIP：非特異性間質性肺炎；UIP：普通型間質性肺炎；PAP：肺泡蛋白沉積癥；hPAP：遺傳性肺泡蛋白沉積癥；BPD：支氣管肺發育不良；Hch：羥氯喹；NO：一氧化氮；ECMO：體外膜肺氧合；GGO：磨玻璃樣變；PF：肺纖維化；FPF：家族
中國循證兒科雜志 2017年6期2018-01-23
- 血液腫瘤患者IDH1/IDH2基因突變發生率及其血液病分布特點研究
實驗共發現了7個錯義的突變基因，其中2個為IDH2基因突變，4個為IDH1基因突變；還有2個IDH1同義突變。4個IDH1的突變類型是：199M、R132C、R131D及R132H，前3個突變患者都出現在3例急性髓系的白血病患者中，最后1例出現在急性淋巴細胞的白血病患者中。2個IDH2的錯義突變類型是：P167R和R172K，這2例也都出現在急性髓系的白血病患者中。在發生IDH1錯義基因突變的4例患者中，其體內白細胞的計數明顯升高，且患者年齡均大于60歲。
實用癌癥雜志 2017年6期2017-07-01
- 新生兒非酮癥性高甘氨酸血癥1例
子上均有一個新的錯義突變：c.2198 C＞T（p.Ala733Val）。該基因突變在人類突變數據庫尚未見記載，經保守性分析，該區為高度保守區域，懷疑是致病突變，見圖4。圖1 患兒頭顱CT平掃：腦白質密度減低（箭頭所示）圖2 患兒振幅整合腦電圖圖3 血氨基酸串聯質譜圖圖4 患兒父母甘氨酸脫羧酶基因（GLDC）測序結果2 討論非酮癥性高甘氨酸血癥（nonketotic hyperglycemia，NKH）是一種累及神經系統發育的常染色體隱性遺傳病，有文獻通過
神經損傷與功能重建 2017年2期2017-04-08
- GFM1突變所致兒童急性肝衰竭1例：質疑GFM1錯義突變位置決定臨床表型
例：質疑GFM1錯義突變位置決定臨床表型尤藝杰1Agnès R?tig2王建設目的 報告GFM1突變所致疾病的臨床特征及驗證基因型和臨床表型關系。方法 回顧性分析1例門診就診的GFM1基因突變兒童的臨床及基因突變資料，結合文獻歸納GFM1基因突變的臨床特點，構建編碼線粒體翻譯因子G1(mtEFG1)空間結構圖，檢驗GFM1基因錯義突變位置與臨床表型關系的假說。結果 患兒，女，6個月28 d。生長發育遲緩，急性肝衰竭。體格檢查：反應差，嗜睡，全身皮膚黏膜黃染
中國循證兒科雜志 2016年5期2016-11-26
- 先天性巨結腸患兒平面細胞極性通路核心基因的突變篩查
出3個基因的9個錯義突變，全部為雜合突變(圖1)，陽性率為10.8%。6例患兒發現CELSR3基因5個錯義突變位點，分別為：c.7724A> (H2575R)、c.6613G>A(A2205T)、c.1961C>T(T654M)、c.2230G>A(V744M)、c.8615C>G(A2872G)，其中2例患兒(HSCR0031和HSCR0048)同時出現c.1961C>T(T654M)錯義突變，且突變位點位于CELSR3基因編碼蛋白的一個Cadherin
安徽醫科大學學報 2016年10期2016-11-25
- 家族遺傳性異常纖維蛋白原血癥家系的基因型分析
。對幾個有疑問的錯義突變位點利用BeckmanCoulter公司的GenomeLabGeXP系統采用引物延伸法進行基因型分析。2 結果先證者纖維蛋白原基因FGA、FGB和FGG的所有外顯子及側翼序列均測通，對測序結果進行分析，沒有發現堿基的插入或缺失。外顯子區共發現7個單核苷酸突變位點，其中4個錯義突變、2個同義突變、一個位于非編碼區；內含子區先證者發現1個SNP位點，正常對照也表現為同樣的堿基突變。經分析，外顯子區的3個錯義突變位點為可疑致病突變位點。這
中國實驗診斷學 2016年9期2016-11-01
- 耳髁突綜合征基因遺傳學的研究現狀
內)所存在的雜合錯義突變，導致了ACS的發生。PLCB4及GNAI3是EDN1-DLX5/DLX6 (endothelin-1-distal-less homeobox 5 and 6)信號通路的重要傳導分子，而這一信號通路對于下頜骨的發育極為重要。他們通過試驗組與對照組的成骨細胞培養，發現ACS患者下游的DLX5與DLX6表達有顯著的下降。Rieder等通過建立斑馬魚與大鼠動物模型，提出以下假說：可能由PLCB4與GNAI3突變所引發的“下頜骨的上頜骨化
中國美容整形外科雜志 2016年12期2016-01-15
- 10例Gitelman綜合征患者SLC12A3基因的檢測
變位點，包括2個錯義突變：Glu429Lys,Ala264Gly；1個缺失突變：1740delC。6個已報道過的突變，其中包括5個錯義突變：Cys430Gly，Asp486Asn，Ser283Tyr，Thr163Met,Arg913Gln；1個缺失突變：2877_2878delAC。10例患者中8例攜帶Ala264Gly純合突變,4例攜帶Asp486Asn雜合突變，大部分患者為復合雜合突變。 結論：本研究共發現9個突變位點，其中3個新突變位點。Gitelm
腎臟病與透析腎移植雜志 2015年5期2015-06-09
- 肌萎縮側索硬化家系致病基因SOD1的突變檢測
一個已知的致病性錯義突變c.(449 T>C)(p.Ile150Thr)。對家系中其他患者和未發病者進行驗證，發現此突變在該家系中與疾病共分離。結論SOD1錯義突變c.(449T>C)(p.Ile150Thr)是該肌萎縮側索硬化家系患者發病的的原因。肌萎縮側索硬化；SOD1；錯義突變肌萎縮側索硬化(aroyotrophic lateral sclerosis, ALS)是最常見的運動神經元疾病，發病率約每年(1～3)/10萬，患病率為每年(4～8)/10萬
中國產前診斷雜志(電子版) 2015年4期2015-05-05
- European Urology:具有ERBB2突變的浸潤性膀胱癌對新輔助化療更敏感
RBB2突變均為錯義突變，大多具有激活該信號的作用。另外在對ERBB2的拷貝數增加進行對比時，沒有發現兩組間差異存在統計學意義。因此，他們推測對具有ERBB2錯義突變的浸潤性膀胱癌患者給予新輔助化療能夠獲得更好的治療效果。在之前的報道中，肌層浸潤性膀胱癌中ERBB2的突變概率為10%左右(TCGA.Nature, 2014, 507(7492), 315-322)；而在微乳頭狀膀胱癌中，這一比例甚至達到40%(ROSS JS，WANG K，GAY L，et
現代泌尿外科雜志 2015年4期2015-02-21
- CYP2A13基因8種錯義突變與肺癌易感性的關聯研究
2A13基因8種錯義突變與肺癌易感性的關聯研究劉亭 李朝輝 謝章明 徐迎春 吳敏良 徐笑紅 陳樞青目的 探討細胞色素p450 2A13（Cytochrome p450 2A13，CYP2A13）基因8種錯義突變與肺癌易感性的相關性。方法采用以自然人群為基礎的病例-對照方法，對2007-2011年間收集的91例肺癌病例以及140例年齡和性別相匹配的正常對照者進行研究。采用等位基因特異擴增法（Allele-Specific Amplification,ASA）
浙江醫學 2014年17期2014-04-13
- 人耳聾相關基因GJB3的結構特征及生物信息學分析
5 GJB3基因錯義突變分析為研究GJB3發生錯義突變后三維結構的改變，選擇了2種錯義突變（p.E183K和p.I141V）進行三維結構突變前后的比較，并分析了Anolea原子平均勢能。采用同源模建軟件SWISS-MODEL模建Cx31蛋白的三維結構，用VMD1.9軟件對突變前后的三維結構進行可視化分析，最后通過Anolea原子平均勢能圖的改變評價錯義突變對Cx31蛋白三維結構的影響。2 結果2.1 GJB3系統發育分析用MEGA5.05構建的Cx31的N
生物技術通訊 2013年1期2013-10-29
- 核苷（酸）類似物治療對乙型肝炎病毒感染者聚合酶區基因變異的影響
與NA耐藥相關的錯義變異6例（2.0%），包括M204I3例、A181T 1例和V173L 2例。同義變異25例（8.5%），包括180位點14例、181和236位點各3例及169和180聯合變異5例。二、停用NA治療后患者發生HBV-P基因RT區變異情況 在49例曾經應用過NA治療患者，在停藥至少3月后，9例（18.4%）檢測到變異位點，包括經典耐藥位點的錯義和同義變異（表1）。表1 停用NA治療后9例患者發生HBV-P-RT變異及類型三、應用NA治療期
實用肝臟病雜志 2013年1期2013-09-20
- 鈉離子通道基因 SCN1A、SCN2A、SCN1B 突變與癲癇
型[3]，且均為錯義突變。同一家系中受累成員表現可不同，輕者僅有熱性驚厥（febrile seizure，FS），重者可表現為癲癇伴肌陣攣站立不能（myoclonic-astatic epilepsy，MAE）及 Dravet 綜合征（Dravet syndrome，DS）等。分析已報道的 20 個有 SCN1A 基因突變的 GEFS+ 家系（共 151 例受累者）表型及所占比例中，最常見的表型是熱性驚厥附加癥（febrile seizure plus，F
中國醫藥生物技術 2013年1期2013-01-22
- 中國X連鎖無丙種球蛋白血癥40例基因型表型相關性分析
例(40.0%)錯義突變，13例(32.5%)無義突變,4例(10.0%)插入突變，4例(10.0%)缺失突變和3例(7.5%)剪接突變。8例位于CpG位點(R13X、R28C、R255X、R520X、R525P、R562L各1例，R525Q 2例)。40例基因突變分布于整個BTK基因編碼區域，其中20例(50.0%)位于激酶(TK)區,9例(22.5%)位于PH區,3例(7.5%)位于TH區,3例(7.5%)位于SH3區，5例(12.5%)位于SH2區(
中國循證兒科雜志 2012年1期2012-01-05
- 原發性高血壓患者G蛋白信號轉導調節蛋白-2基因的測序分析
5各檢出1個新的錯義突變(K18N和Y178C)；-638A>G、-395G>C、1891-1892TC I/D和 2971G>C 以及-43A>T 和 2297A>G 之間存在連鎖不平衡關系(r2≥0.8)。結論RGS2基因在新疆哈薩克族高血壓患者中檢出的變異位點及頻率存在種族特異性，外顯子區的錯義突變頻率較低，是否影響血壓調節需進一步的功能驗證。G蛋白信號轉導調節蛋白-2；原發性高血壓；單核苷酸多態性；錯義突變；哈薩克族G蛋白家族是心血管細胞信號轉導和
中國醫學科學院學報 2011年2期2011-11-23
- 線粒體DNA遺傳變異與人類環境適應性
洲居民中均發現有錯義突變，nDNA基因的突變則表現出與地理區域相關性［2，18］。研究者繼續對mtDNA遺傳變異的地理區域性分布進行了更深入的研究。對從現有的2565個mtDNA序列演繹出的mtDNA進化圖進行分析發現，從熱帶非洲單倍型L的100%到歐亞大陸M+N單倍型的140%，到寒帶N單倍型的180%，進化樹內部分枝的錯義突變發生頻率是逐漸增多的。而且，熱帶非洲群體的內部分枝上氨基酸變化的種內CI(氨基酸功能發生改變的重要性標志)也較北極群體有所增加。
中華肺部疾病雜志(電子版) 2011年6期2011-08-15
- 視網膜色素變性患者視紫紅質基因突變分析
平衡。其中2種為錯義突變，V104I僅在RP組出現，A299S在RP組及對照組中各有1例。其余5種為非編碼區突變，且在對照組中也發現相應堿基突變，考慮為SNP，在NCBI－SNP數據庫中進行檢索，兩組各SNP位點突變頻率比較，差異均無統計學意義 (P＞0.05，見表2)。表2 檢出的RHO基因點突變Table 2 RHO sequence alterations detected in the study圖1 PCR擴增產物2%瓊脂糖凝膠電泳圖Figure
中國全科醫學 2011年15期2011-04-20
- 鈉離子通道基因SCN1A突變及其相關癲綜合征
突變類型，且均為錯義突變(http://www.molgen.ua.ac.be/SCN1AMutations/ Mutations/ Default.cf-m)。GEFS+家系具有遺傳異質性，雖然SCN1A基因是GEFS+最常見的致病基因；但SCN1B和氨基丁酸受體γ2亞單位基因(GABRG2)基因突變也與GEFS+家系發病有關[12，16，17]；SCN2A和GABRD基因突變也分別見諸于一個GEFS+家系報道[18，19]。表1 20個SCN1A 基因
中國循證兒科雜志 2011年4期2011-01-19
- CX26不同結構域錯義突變體的表達和定位*
中各選擇1個致聾錯義突變(表1和圖1)，觀察突變體蛋白在HeLa細胞的表達及定位，為進一步研究CX26致聾突變體組裝、運輸和定位及間隙連接通信功能奠定基礎。1 材料與方法1.1實驗材料 pEGFP-N1載體、HeLa細胞和大腸桿菌Top10菌種由中南大學醫學遺傳學國家重點實驗室提供。HeLa細胞是一種很容易離體培養的細胞，該細胞沒有內源性的間隙連接表達，因此被廣泛應用于間隙連接蛋白功能分析的體外實驗[5]。Pyrobest 酶、dNTP 和限制性內切酶Ec
聽力學及言語疾病雜志 2010年3期2010-01-25