?

E輪融資高達5800萬美元,藥明康德被投企業DNAnexus正在打造基因數據戰艦

2018-08-22 07:32
智慧健康 2018年18期
關鍵詞:基因組學儲存基因組

基因測序價格的向下飛躍給予了基因監測、精準治療領域極大的價值。與此同時,基因數據的儲存與分析處理成為眾多企業追逐的香餑餑。在這個時代,掌握了數據就掌握了主動權。

基因測序價格的向下飛躍給予了基因監測、精準治療領域極大的價值。與此同時,基因數據的儲存與分析處理成為眾多企業追逐的香餑餑。在這個時代,掌握了數據就掌握了主動權。

DNAnexus就是這樣一家公司,在眾多基因數據儲存企業中脫穎而出。它專注于為用戶提供DNA數據儲存、共享、分析、管理等服務。2018年1月,公司結束E輪融資,融資金額總計5800萬美元。

基因數據的儲存、管理與分析

基因組測序的發展面臨三大挑戰:

第一,需要極大的磁盤空間存儲基因組大數據;

第二,需要足夠快的網絡傳輸速度促進數據共享;

第三,基因組大數據的分析和處理預計會話費數萬億個CPU小時。

一般而言,研究機構或醫院沒有足夠的儲存空間儲存如此巨量的數據。即便有能力儲存,但也不能保證收集的數據立即派上用場,這也會帶來一大筆成本,超過儲存數據帶來的收益。

DNAnexus的云儲存功能完全契合醫院、研究機構的需求,它的存儲中心可以低成本、高速率存儲和調用數據。

為了保證數據能夠快速上傳至云端,DNAnexus提供多種方式上傳云端數據。用戶可以使用命令行上傳;通過網絡平臺上傳;從URL獲??;或者通過DNAnexus API直接上傳。

DNAnexus平臺的API支持任何數據格式及基于Linux的軟件。 通過DNAnexus平臺,生物制藥公司及其合作伙伴可以根據PHI要求安全地搜索患者健康狀況和遺傳學之間的關系。

生物制藥公司可使用DNAnexus與醫療健康合作伙伴進行聯系,將患者表型信息和基因組信息結合起來,推動開展藥物發現、挑選臨床試驗參與者等活動。

除了支持任何數據格式之外,該平臺的API還支持與LIMS,測序儀器以及三級分析和報告軟件的端到端集成。 DNAnexus提供全球網絡,將制藥公司與醫療保健提供商,醫院和臨床實驗室連接起來,以加速基因組學在診所的影響。

所有上傳的數據均會在云端加密,整個傳輸過程都將被跟蹤控制。DNAnexus把數據的安全性問題看作自己的核心目標之一,在一般情況下,用戶可以完全放心基因數據的安全性。

DNAnexus的服務也可解決基因組測序面臨的第三個問題。它提供1000個節點,可同時處理百萬個對象。用戶可在云端直接執行數據分析,無需下載海量數據。同時,整個使用過程也將全程進行加密處理。

DNAnexus曾分別與斯坦福大學與貝勒醫學院合作推出了一個大型項目以展示該平臺對于大規?;驍祿幚淼膬r值。在這兩個項目里,DNAnexus 共處理了 17000 個基因組,生成的基因數組超過 500TB。所生成數據可在平臺上訪問供后續分析與數據共享使用。

E輪融資高達5800萬美元,藥明康德被投企業DNAnexus正在打造基因數據戰艦

DNAnexus及其團隊

DNAnexus的成立可以追溯到2009年的斯坦福大學,位于灣區三藩市山景城。DNAnexus是一家B2B的基因大數據公司,為基因公司的大數據分析和管理提供云平臺服務。

Richard Daly任DNAnexusCEO,他在健康管理和基因組學領域面擁有三十年的管理經驗。 Daly過去在健康管理和健康實驗領域均成立過企業,同時也是實驗室基因測序和生物信息學先驅Visible Genetics(納斯達克股票代碼:VGIN)的首席執行官。他曾獲得紐約大學金融學士學位和哈佛大學工商管理碩士學位。

首席技術官George Asimenos博士自DNAnexus成立以來一直參與設計和調試DNAnexus產品線,并將其交付于全球客戶。 他目前正在開展戰略項目,探索如何使用DNAnexus技術超越傳統基因組學界限。George擁有斯坦福大學計算機科學博士學位,他曾在那里參與了人類組基因測序計劃。 他的研究經歷包括比較性宏基因組學,用于可重構硬件的硅片編譯器和橢圓曲線密碼分析。

Andrew Carroll博士在DNAnexus任科學副總裁。 他幫助運行了最大的云基因組學項目,該項目與CHARGE Consortium和Baylor醫學院共同完成,涵蓋20,000個基因組/外顯子組,迄今為止進行的最大的植物基因組學項目涵蓋了3000個水稻基因組計劃中的3000個水稻基因組。 通過DNAnexus科學團隊的工作,他曾在個人和群體、基因表達分析、基因結構變異分析、基因組組裝、腫瘤正常分析,計算化學和圖像處理等方面開展了SNP和indel調用的臨床和研究項目 。 他擁有斯坦福大學獲得博士學位,其學術工作涉及植物比較基因組學,蛋白質組學和機器學習。

融資情況

E輪融資高達5800萬美元,藥明康德被投企業DNAnexus正在打造基因數據戰艦

DNAnexus融資情況

從融資情況來看,領頭企業GV、TPG Biotech等均在投資領域有較高的知名度,其行為本身也隱含著極大的價值。

?

2015年4月,藥明康德獨投1500萬美元凸顯中國科技企業試圖打入基因市場的決心。

2018年初完成的E輪融資主要用于研究醫療解決方案,擴大其在臨床醫學研究領域的發展。這可能隱含DNAnexus從基因數據出發,輻射精準醫療各行業的野心。

微軟Healthcare NExT計劃中重要的一環名為Microsoft Genomics,這是微軟進入精準醫療領域關鍵的一步。DNAnexus無疑可以讓微軟的工作事半功倍,未來發展可期。

未來發展

隨著基因組分析整合到臨床前階段和臨床階段,DNAnexus將提供全球網絡來幫助基因組和臨床數據整合分析,加速發掘基因差異對臨床結果的影響。

DNAnexus建立在Microsoft Azure和亞馬遜網絡服務的基礎之上,并擁有可擴展的基礎架構,可通過“單一平臺”立即滿足各類計算和數據存儲需求。在DNAnexus進行分析計算時,所有數據和計算工具受同一系統控制,消除重復計算,可提高運算速度并降低能耗成本。

對于臨床研究人員來說,DNAnexus網絡環境提供了一個人性化的操作界面。除了豐富的統計功能,DNAnexus平臺還允許醫療機構開發新的分析工具。研發者既可以使用DNAnexus應用程序庫中已有的組件,也可以將現有的應用程序和管道移植到DNAnexus中。

從DNAnexus自身業務開展情況情況及技術研發、投資方參與情況及基因領域發展情況看,這家未來獨角獸的發展不可限量。隨著基因檢測技術深入百姓家,DNAnexus的業務量將迎來新的爆發點。

猜你喜歡
基因組學儲存基因組
牛參考基因組中發現被忽視基因
冬季養羊這樣儲存草料
山西在谷子功能基因組學研究領域取得重大突破
科學家找到母愛改變基因組的證據
血清HBV前基因組RNA的研究進展
新疆和西藏少數民族的群體基因組學研究
系統基因組學解碼反芻動物的演化
紫花白及基因組DNA提取方法的比較
安防云儲存時代已來
華法林出血并發癥相關藥物基因組學研究進展
91香蕉高清国产线观看免费-97夜夜澡人人爽人人喊a-99久久久无码国产精品9-国产亚洲日韩欧美综合