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轉錄因子Dlx1在HT22細胞中調控CRMP2轉錄活性的研究

2020-05-13 14:38束慧
科教導刊·電子版 2020年3期
關鍵詞:熒光素酶質粒引物

束慧

摘 要 目的:觀察轉錄因子Dlx1對小鼠海馬神經元細胞HT22細胞CRMP2( Collapsin response mediator protein 2)基因的調控作用。方法: 構建pcDNA3.1-HA-Dlx1質粒及pGL3.0-Basic-CRMP2 promoter質粒,采用雙熒光素酶報告基因檢測系統檢測Dlx1對CRMP2基因啟動子轉錄的影響; 檢測過表達Dlx1對內源CRMP2基因表達的影響。結果:Dlx1直接結合在CRMP2啟動子上,促進CRMP2基因表達。結論: Dlx1促進CRMP2基因表達。

關鍵詞 Dlx1 腦衰反應調節蛋白-2 啟動子 雙熒光素酶基因檢測

中圖分類號:R780.2文獻標識碼:A

腦衰反應調節蛋白2 (Collapsin response mediator protein 2, CRMP2)是CRMPs家族成員之一,均由564-572個氨基酸殘基組成。人源CRMP2基因定位于8p21.2,轉錄本Ⅱ與小鼠CRMP2基因編碼的蛋白氨基酸殘基長度均為572aa,只有兩個氨基酸不同。CRMP2表達量的下降和活性的降低均會引起神經系統疾病,如帕金森疾病、精神分裂癥和阿爾茨海默癥等。

Dlx1屬于Dlx基因家族成員之一,有研究表明Dlx家族基因在神經元發育中有很重要的作用。本實驗通過觀察Dlx1對CRMP2基因啟動子轉錄活性的影響,以及轉錄活性之間的關系,為進一步研究CRMP2基因表達的調控奠定了一定基礎。

1材料與方法

1.1主要試劑與儀器

HT22細胞株(實驗室保留);CRMP2質粒構建引物(蘇州金唯智生物科技有限公司);二抗山羊抗兔(美國Abcam,ab6721);CRMP2 siRNA(吉瑪基因股份有限公司); CRMP2抗體(美國Abcam,ab129082);Lipofectamine 2000轉染試劑(美國Invitrogen, 11668019);蛋白濃度測定試劑盒(碧云天,p0012);胎牛血清(美國Hyclone,Sh30370.03);RPMI-1640培養基(美國Hyclone,Sh30809.01);Ripa裂解液(康為世紀, ?CW2334);DNA質粒小提試劑盒(天根生化科技有限公司);雙熒光素酶報告基因檢測系統(美國 Promega 公司)。

1.2質粒構建

采用PCR方法擴增得到鼠源Dlx1 cDNA片段,使用EcoR1/BamH1限制性內切酶處理后插入pcDNA3.1-HA載體,構建成pcDNA3.1-HA-Dlx1質粒,PCR引物序列:上游引物序列- CCG GAATTC ATGACCATGACCACCATGCCAG,下游引物序列- GCG GGATCC TCACATCAGTTGAGGCTGCTGC。采用PCR方法擴增得到鼠源CRMP2啟動子片段,使用Kpn1/Mlu1限制性內切酶處理后插入pGL3.0-Basic載體,構建成pGL3.0-Basic-CRMP2 promoter質粒,PCR引物序列:游引物序列-CGG GGTACCAAATATAAATATATATATATTTTAA,下游引物序列-GCACGCGT TCTCTCCGGGGGGCGGGAGGAAG。

1.3 ?Dlx1對CRMP2啟動子(-102- +1)103bp轉錄活性的影響

1.3.1不同濃度Dlx1對CRMP2啟動子轉錄活性的影響

HT22細胞株培養于RPMI-1640培養基(含10%胎牛血清,1%霉素/鏈霉素雙抗),置 5% CO2,37℃細胞培養箱培養。取生長狀態穩定HT22細胞鋪板,培養過夜,待細胞豐度達到大約70%時,按照Lipofectamine 2000轉染試劑說明書進行轉染。將pcDNA3.1-HA載體,pcDNA3.1-HA-Dlx1質粒分別按不同的濃度(50ng,100ng,200ng)和pGL3-Basic -CRMP2 promoter質粒(300ng),Renilla質粒(10ng)共轉染到12孔板 HT22細胞,各轉染3個孔。48 h后收集細胞,分別使用100L 細胞裂解液裂解細胞,充分裂解,離心后取20L上清液用于雙熒光素酶報告基因試劑盒檢測,具體步驟參考說明書。

1.3.2小鼠CRMP2基因啟動子特征性序列的定點突變

將小鼠CRMP2啟動子序列進行轉錄因子結合位點分析(http://jaspar. genereg.net/cgi-bin/jaspar_db.pl),結果顯示轉錄因子Dlx1在預測得到的CRMP2啟動子區域具有潛在結合位點(tataaatata)。設計突變引物,將tataaatata序列突變掉構建突變質粒,將得到的突變質粒送至蘇州金唯智生物科技有限公司測序,將所得結果使用NCBI。

1.3.3檢測Dlx1對CRMP2野生型和突變型基因啟動子轉錄活性的影響

將pcDNA3.1-HA載體,pcDNA3.1-HA-Dlx1質粒分別和pGL3.0-Basic -CRMP2 promoter質粒及突變質粒,Renilla質粒共轉染到12孔板HT22細胞,各轉染3個孔。按照Lipofectamine 2000轉染試劑說明書進行轉染。將pcDNA3.1-HA-Dlx1質粒按不同的濃度(50ng,100ng,200ng)分別和pGL3.0-Basic -CRMP2 promoter質粒/突變質粒(300ng),Renilla質粒(10ng)共轉染到12孔板 HT22細胞,各轉染3個復孔。48 h后收集細胞,分別使用100L 細胞裂解液裂解細胞,充分裂解,離心后取20L上清液用于雙熒光素酶報告基因試劑盒檢測,具體步驟參考說明書。

1.4 ?Dlx1促進內源性CRMP2基因表達

將pcDNA3.1-HA載體和pcDNA3.1-HA-Dlx1質粒分別轉染到12孔板HT22細胞中,每孔轉染500ng,各轉染6個復孔;在HT22細胞中分別轉染10ul NC siRNA和siRNA CRMP2(濃度均為1nM)。48h后,提取mRNA和蛋白質,分別做Q-PCR和Western Blot檢測CRMP2的mRNA和蛋白變化。Q-PCR引物序列:上游引物序列-GGGATCTGATGCTGACTTGGTC,下游引物序列-GGGAATGTAGCGTCCTGAGC。將收集的蛋白質采用BCA試劑盒定量后,濃度調至一致,加入5咨涎撼逡海?5 ℃煮沸15 min。將30ug蛋白樣品加到10%聚丙烯酰胺凝膠電泳(SDS-PAGE)凝膠上樣孔中,80V電泳20min,120V電泳120min,使用PVDF膜轉膜 (恒定電流:330 mA,70min)。室溫下5%的小牛血清封閉1 h,孵育CRMP2及GAPDH抗體(1:5000)室溫2h,TBST洗膜4次,每次5 min,孵育山羊抗兔二抗(1:10000)室溫下孵育1 h,洗膜4次,每次5 min,ECL發光液曝光收集結果。

1.5統計學處理

實驗數據采用單因素方差分析和雙因素方差分析來進行顯著性分析,p<0.05 表示差異具有統計學意義,用Graph Pad Prism進行統計學分析,數據均以均值北曜嘉蟊硎盡?

2結果

2.1不同濃度Dlx1對CRMP2啟動子轉錄活性的影響

檢測不同濃度的轉錄因子Dlx1質粒與pGL3.0-Basic -CRMP2 promoter質粒共轉染HT22細胞時發現,隨著Dlx1濃度的增高,pGL3.0-Basic -CRMP2 promoter質粒的熒光素酶活性顯著增高,差異有統計學意義( P <0.001) ,結果如圖1所示。

圖1:pcDNA3.1-HA載體,不同濃度的轉錄因子Dlx1質粒分別與pGL3.0-Basic -CRMP2 promoter質粒共轉染HT22細胞,以Renilla為內參,使用雙熒光素酶報告基因試劑盒檢測熒光酶的活性,結果顯示,隨著轉錄因子Dlx1濃度的增高,熒光素酶的活性也隨之增強,p<0.001。

2.2 ?Dlx1對CRMP2野生型和突變型啟動子質粒熒光素活性的影響

通過生物信息學的分析,我們將Dlx1在預測得到的CRMP2啟動子區域具有潛在結合位點,通過PCR定點突變的方法去掉,構建突變質粒。然后將Dlx1分別與CRMP2野生型和突變型啟動子質粒轉染,檢測熒光素酶的活性。Dlx1對野生型CRMP2啟動子質粒熒光素活性有激活作用,差異有統計學意義(p<0.001);對CRMP2突變型啟動子質粒熒光素活性無明顯激活作用,差異無統計學意義(p>0.05),結果如圖2所示。

圖2:pGL3.0-Basic-CRMP2 promoter質(下轉第293頁)(上接第288頁)粒中的Dlx1結合位點突變后,Dlx1不能促進光素酶的活性增強,差異無統計學意義(p>0.05),說明Dlx1可以直接結合在CRMP2啟動子,并促進其轉錄。

2.3 ?Dlx1促進內源性CRMP2基因表達

將不同濃度pcDNA3.1-HA-Dlx1質粒瞬時轉染到HT22細胞,采用Q-PCR和Western Blot方法檢測CRMP2 mRNA和蛋白水平的變化,CRMP2 mRNA和蛋白水平均升高,有統計學意義(p<0.05,p<0.001),結果如圖3-A和3-B所示;在HT22細胞中Knock-down Dlx1,CRMP2 mRNA和蛋白水平均下降,有統計學意義(p<0.05)結果如圖3-C和3D所示,說明Dlx1可以促進CRMP2基因表達。

圖3-A:不同濃度過表達Dlx1組與對照組相比,CRMP2 mRNA水平顯著升高,差異有統計學意義(p<0.05,p<0.001);圖3-B:不同濃度過表達Dlx1組與對照組相比,CRMP2 蛋白水平顯著升高,差異有統計學意義(p<0.05);圖3-C:Knock-down Dlx1組與對照組相比,CRMP2 mRNA水平下降,差異有統計學意義(p<0.05);圖3-D:Knock-down Dlx1組與對照組相比,CRMP2 蛋白水平下降,差異有統計學意義(p<0.05)。

3討論

近年來,蛋白質組學已得到廣泛應用,為一些疾病發病機制的研究帶來了更寬廣的思路。諸多實驗已證明,CRMP2在神經系統疾病中起到重要作用,其表達貫穿神經元生命始終,發育階段達到高峰。同時CRMP2的表達量和神經元位置也有相關性,例如,在小腦、海馬和嗅球等處CRMP2 表達較多。

本實驗通過采用生物信息學的方法,預測出轉錄因子Dlx1可能調控CRMP2的基因表達,并通過相關實驗加以驗證,首次發現,轉錄因子可以直接結合在CRMP2啟動子上,并促進CRMP2基因表達?;蜣D錄過程十分復雜,通常情況下,許多轉錄因子形成復合物共同起調控作用,所以我們不能排除還有其他轉錄因子也參與這一調控過程,具體還有哪些轉錄因子參與調控有待我們進一步研究探索。

綜上所述,轉錄因子Dlx1與CRMP2啟動子相互結合從而調控其表達水平,為一些疾病發病研究和治療提供一定的理論支持。

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