陳霞 丁勁峰
摘? 要:短串聯重復序列(short tandem repeat,STR)又稱微衛星DNA(micro satellite DNA),是一類廣泛存在于人類基因組中的DNA多態性基因座。它由2-6堿基對構成核心序列,呈串聯重復排列。STR基因位點長度一般在100~300bp之間。因個體間DNA片斷長度或DNA序列差異而成高度多態性,在基因傳遞過程中遵循孟德爾共顯性方式遺傳。因其基因片段短、擴增效率高、判型準確等特點,已廣泛應用于法醫學個體識別和親子鑒定等領域。該文報道在法醫物證鑒定實踐過程中一例2個STR基因突變的單親親子鑒定,目前這兩個位點突變的報道尚不多,以期在后續實踐過程中提供更多有研究價值的參考。
關鍵詞:法醫物證學? STR? Y染色體? 突變
中圖分類號:D919 ? ?文獻標識碼:A 文章編號:1672-3791(2020)06(a)-0187-02
1? 案例
1.1 簡要案情
因公安戶籍登記需要,基層派出所委托本鑒定機構對自稱是孩子父親的男子(31歲)與孩子(報4月齡)進行親子鑒定,孩子生母2月前離家出走,下落不明。按照規范采集兩者指尖末梢血樣。
1.2 檢驗結果
采用Identifiler-PLUS試劑盒(美國)直接擴增檢測,發現二者在D3S1358等位基因座不符合遺傳規律,取平均突變率u=0.002[1],按照司法部親權鑒定技術規范(SF/Z JD0105001-2010)(以下簡稱規范)及公安部法庭科學DNA親子鑒定規范(GA/T 965-2011),計算CPI值為214.2019,達不到認定父權的標準,但也不能排除。根據規范要求,采用AGCU Expressmarker 22試劑盒(無錫中德美聯)重新檢測常染色體STR檢測,并采用AGCU 21+1 STR試劑盒(無錫中德美聯)增加常染色體位點檢測,并用Yfier Direct試劑盒(美國)進行二者Y-STR檢測,在已檢測的39個常染色體STR及16個Y-STR中,發現D3S1358、D17S301兩個等位基因座不符合遺傳規律。
按規范對突變基因座進行親權指數(PI)、累積親權指數(CPI)和親權概率(W)計算[2]。各STR基因座分型結果和PI值計算結果見表1。
2? 討論
STR突變是DNA在復制過程中,DNA聚合酶發生滑脫導致核心序列重復次數發生改變所致,中國人常用的STR基因座平均突變率為0%~0.492%[3]。因為STR基因突變比較罕見,兩個等位基因同時突變的發生的概率更低,但在以往文獻報道中也是有出現,此例中疑父與小孩有2個常染色體不符合遺傳規律,且經一步突變均可形成,即D3S1358基因座,疑父為18,小孩為17,D17S301位點,疑父為13,小孩為12,但生母未參與鑒定的情況,報道較少,認定難度較大[4,5]。
親子鑒定中,僅有少數STR(通常1~2個)基因座違反遺傳規律時,通常要考慮是突變,還是近親干擾。當疑父與孩子的生父具有較近的血緣關系時,應避免錯誤認定父權的風險。在排除近親及雙胞胎的前提下,當父親與孩子在基因遺傳中確實出現基因突變時,應避免出現錯誤排除父權的風險。
根據規范要求,若有基因座不符合孟德爾遺傳規律,不能為了獲得較高的PI值,將檢測到的不符合遺傳規律的遺傳標記刪除,應該增加檢測STR基因座的數量,也可以通過補充小孩母親樣本,確定突變來源。如鑒定父子關系時,可增加檢測Y染色體遺傳標記,在鑒定母女關系時,可以增加檢測線粒體DNA(mt-DNA)遺傳標記,但其基因頻率不能采用概率累乘,所有的全部線粒體DNA(mt-DNA)基因座應作為一個整體,用其單倍型頻率帶入計算。綜合分析得出意見。
此例中,在常規檢測發現一個STR基因座不符合遺傳規律,在小孩生母無法提供樣本的情況下,通過增加常染色體STR位點及Y-STR基因座的檢測,雖又發現D17S301等位基因不符合遺傳規律,但計算CPI,已達到認定親權的標準,故基于目前已知的條件和DNA檢測結果,支持被檢測男子和孩子存在親緣關系。
綜上,STR基因座違反遺傳規律的案例雖少見,但已為人們所關注,在個別STR基因座違反遺傳規律的案例應該謹慎對待,可要求生母參與鑒定及增加檢測基因座,計算CPI值,按規范標準判定,必要時還應及時與委托單位或者被鑒定人進行溝通,了解其個人與家庭成員情況,盡可能避免鑒定差錯。
參考文獻
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[3] 李海霞.孫宏鈺.3個STR基因座同時突變的親子鑒定案1例[J].中國法醫學雜志,2009,25(4):319-320.
[4] 陳勇,孫宏鈺,伍新堯,等.親子鑒定中3個STR基因座存在變異分析1例[J].法醫學雜志,2003,19(3):188-189.
[5] 畢潔,李妙霞.2個STR基因座突變親子鑒定1例[C]//全國第九次法醫學術交流會論文集.2013:156-157.