?

MEFV基因的新發突變導致周期性發熱

2023-12-22 00:45超,喻
湖北理工學院學報 2023年6期
關鍵詞:雜合外顯子基因突變

袁 超,喻 昕

(肇慶醫學高等??茖W校 科研實驗中心,廣東 肇慶 526020)

周期性發熱-阿弗他口炎-咽炎-淋巴結炎(PFAPA)綜合征是兒童期最常見的自身炎癥性疾病之一,典型的臨床癥狀為高燒(>38 ℃),且無上呼吸道感染的情況,發熱時至少伴有口腔炎、咽炎、淋巴結炎3種癥狀中的一種。發熱通常持續2~8 d,每3~8周發作一次,周期性發熱至少持續6個月以上?;颊咴趦纱伟l病間期無癥狀,且生長發育正常,其它可能出現的癥狀包括腹痛、關節痛等。該疾病常見于5歲以下的兒童,但也有成年人患病的報道。

PFAPA綜合征以散發為主,主要呈常染色體顯性遺傳。雖然PFAPA綜合征具體的發病機制尚未明確,但其它以發熱為主要表型的自身炎癥性疾病,包括家族性地中海熱、甲羥戊酸激酶缺乏癥、腫瘤壞死因子受體相關周期性綜合征、Cryopyrin相關周期性綜合征,均表現出單基因突變致病。因此,遺傳因素也參與PFAPA綜合征的發病,與該疾病相關的致病基因可能包括MEFV、NLPR3、TNFRSF1A、NOD2、MVK。

本研究收集了1例診斷為PFAPA綜合征的患者,遺傳分析發現了MEFV基因的一個新的突變(c.334G>A,p.E112Q);患者攜帶該位點的雜合突變,而患者父母均不攜帶該突變,該突變為一個新發突變。本研究擴展了PFAPA綜合征的突變譜。

1 材料和方法

1.1 血液基因組提取

獲取知情同意書后,使用EDTA抗凝管采集患者及家屬外周血。提取基因組DNA時,將血液轉移至離心管并加入紅細胞裂解液(Solarbio,中國),充分裂解紅細胞后離心收集白細胞,并加入白細胞裂解液(百奧萊博,中國),60 ℃水浴2 h,以3∶1體積比加入乙酸鉀溶液(Solarbio,中國)并顛倒混勻。離心收集上清液,使用異丙醇(國藥集團,中國)沉淀DNA,并使用75%乙醇清洗DNA 3次。室溫放置10 min,DNA充分干燥后,加入Buffer TE(Cwbio,中國),并于50 ℃干浴1 h,振蕩混勻后于-80 ℃條件下保存備用。

1.2 全外顯子組測序

患者的基因組DNA使用SureSelect試劑盒(Agilent Technologies,美國)進行文庫制備以及外顯子捕獲;使用HiSeq2000測序儀(Illumina,美國)進行全外顯子組測序。測序結果經過濾去除接頭讀長、低質量讀長、同義突變以及SNP后,使用NCBI CCDS、RefSeq、Ensembl和Encode數據庫對剩余突變進行注釋。

1.3 Sanger測序

使用Sanger測序對全外顯子組測序測得的突變進行驗證。PCR反應在含有20 ng人類基因組DNA的標準PCR緩沖液(50 μL)中進行。使用正向引物(5'-CGCGCCCGGCCCGTTGTTTT-3')和反向引物(5'-CGCCCCCCGCCAGCCCCT-3')對MEFV基因的突變位點進行擴增。PCR的擴增產物使用Cwbio凝膠提取試劑盒(Cwbio,中國)進行純化,使用BigDye Terminator Cycle Sequencing試劑盒(Applied Biosystems,美國)進行單鏈擴增,使用ABI 3500遺傳分析儀(Applied Biosystems,美國)進行Sanger測序。

2 結果

2.1 病例描述

患者為23月齡的男孩,在11月齡后開始出現周期性發熱,每次發熱持續4~5 d,每次間隔3~5周。每次發熱時,紅細胞沉降率(ESR)、C反應蛋白(CRP)指標升高,并伴有咽炎、扁桃體腫大化膿、淋巴結腫大,無其它臨床癥狀,發熱間期恢復正常?;颊吒改笩o異常,否認有家族史?;颊弑辉\斷為周期性發熱-阿弗他口炎-咽炎-淋巴結炎(PFAPA)綜合征。

2.2 遺傳分析

患者遺傳家系圖譜如圖1所示。對患者的全外顯子組測序結果進行分析,發現PFAPA綜合征可能的致病基因中僅MEFV基因發生了突變(c.334G>A, p.E112Q)。該突變位于MEFV基因的2號外顯子,且尚未見報道,是MEFV基因的一個新的突變。Sanger測序結果(如圖2所示)表明,患者攜帶該位點的雜合突變,而患者父母均不攜帶該突變,說明c.334G>A是一個新發突變。使用HomoloGene數據庫(www.ncbi.nlm.nih.gov/homologene/)對突變的保守性進行分析,不同物種MEFV蛋白的氨基酸序列如圖3所示。由圖3可知,p.E112位點在不同物種中高度保守,提示該位點可能對MEFV編碼的蛋白功能具有重要影響。

圖1 患者遺傳家系圖譜

圖2 Sanger測序結果

圖3 不同物種MEFV蛋白的氨基酸序列

3 討論

自身炎癥性疾病(Autoinflammatory Diseases,AIDs)是由于固有免疫系統缺陷或失調引起的炎癥反應疾病。根據最新的免疫出生錯誤分類,AIDs可分為I型干擾素病、炎癥小體病、非炎癥小體相關疾病3大類。AIDs種類多,臨床診斷需要參照對應的診斷標準。然而,由于目前對疾病的認識尚不夠充分,導致了同一疾病在不同的標準中的診斷指標不盡相同,因此,對于高度懷疑的病例,需要通過基因檢測進一步進行確診。家族性地中海熱(Familial Mediterranean Fever,FMF)和PFAPA綜合征均是以發熱為主要表型的炎癥小體病。MEFV基因突變既可能導致FMF,也可能導致PFAPA綜合征。然而,FMF的主要表型是反復發熱以及漿膜炎,發熱持續1~3 d,通常伴有腹痛。本研究發現的病例發熱持續時間為4~5 d,不伴有漿膜炎,但每次發熱伴有咽炎、扁桃體腫大化膿、淋巴結腫大,符合PFAPA綜合征的臨床特征,而不符合FMF的臨床特征,因此被診斷為PFAPA綜合征。

MEFV基因編碼Pyrin蛋白。Pyrin蛋白是一種炎癥小體蛋白,是先天免疫的感受器,主要定位在粒細胞、單核細胞和樹突狀細胞,感知各種細菌毒素對宿主細胞Rho GTPases的修飾和失活,在抗細菌天然免疫中發揮重要作用。病原體可以通過調節Rho GTPase的活性來抑制宿主的免疫反應。Pyrin蛋白特異性地感知RhoA小G蛋白的活性變化。在正常的生理狀態下,RhoA與絲氨酸/蘇氨酸蛋白激酶PKN1和PKN2結合,激活的RhoA會通過PKN介導的磷酸化來抑制Pyrin蛋白的活性。病原體感染會下調RhoA活性,并導致Pyrin蛋白活性升高;而MEFV基因的致病突變在沒有病原體感染的情況下,會導致Pyrin蛋白活性升高,介導促炎性細胞因子釋放,并導致自身炎癥性疾病。

MEFV基因突變多見于FMF患者,然而,越來越多的報道表明,PFAPA綜合征的患者也攜帶MEFV基因的突變。Cazeneuve等[1]對6名猶太血統的PFAPA綜合征患者進行測序,發現1名患者攜帶M694V突變;Padeh等[2]對28名阿拉伯和猶太血統的PFAPA綜合征患者進行測序,發現6名患者攜帶M694V雜合突變。然而,這些突變在對應遺傳背景中的正常人中的突變頻率也較高。因此,這些報道的研究者認為這些突變可能和PFAPA綜合征無關。但是,也有研究表明,PFAPA患者攜帶的這些MEFV基因突變的頻率遠高于正常人群中的基因突變頻率。在健康的土耳其人中,M694V、E148Q、V726A、M680I、M694I的突變頻率分別為3%、12%、2%、5%、0%。Gül?in等[3]對157名土耳其PFAPA患者的MEFV基因的這5個位點進行測序,在46名患者中發現了雜合突變,19名攜帶M694V突變,16名攜帶E148Q突變,7名攜帶V726A突變,3名攜帶M680I突變,1名攜帶K695R突變;沒有患者攜帶純合突變。Efrat等[4]對57名以色列PFAPA患者的MEFV基因的這5個位點也進行了測序,發現16名患者攜帶雜合突變,包括9名攜帶M694V突變,5名攜帶V726A突變,2名攜帶E148Q突變。Seyed等[5]對44名伊朗PFAPA綜合征患者進行遺傳分析,發現16名患者攜帶MEFV基因突變,包括13名患者攜帶E148Q的雜合突變,2名患者攜帶P369S/R480Q的復合雜合突變,1名患者攜帶R761H雜合突變。這些結果表明,MEFV基因的突變不僅僅和遺傳背景有關,很可能也參與了PFAPA綜合征的發病。

其他人種中的MEFV基因的突變也可以導致PFAPA綜合征。Taniuchi等[6]對20名日本PFAPA綜合征患者進行分析,13名患者攜帶MEFV基因雜合突變,包括11名患者攜帶E148Q的雜合突變或包含該位點的復合雜合突變,1名患者攜帶R202Q的雜合突變,1名患者攜帶P115R的突變;E148Q的突變頻率(44%)顯著高于健康人(13%)。1例成年發作的PFAPA綜合征患者也攜帶MEFV基因的E148Q雜合突變[7]。余婷婷等[8]對9名中國的PFAPA綜合征患者進行遺傳分析,發現4名患者均攜帶MEFV基因的E148Q雜合突變。和不攜帶MEFV基因突變的患者相比,攜帶MEFV基因突變的患者發熱持續時間更短,口腔潰瘍的頻率也更低[6]。本研究發現的PFAPA綜合征患者攜帶MEFV基因E112Q雜合突變。該突變在不同人群中的突變頻率均小于0.01,并且該位點在進化中高度保守。因此,患者的表型可能是由于該位點發生了突變,影響了Pyrin蛋白功能所導致。

總之,本研究發現了MEFV基因的一個新發突變(c.334G>A,p.E112Q),擴展了PFAPA綜合征的突變譜,進一步明確了MEFV基因的突變會導致PFAPA綜合征,增強了對PFAPA綜合征的認識,有助于該疾病在臨床上的確診。

猜你喜歡
雜合外顯子基因突變
大狗,小狗——基因突變解釋體型大小
外顯子跳躍模式中組蛋白修飾的組合模式分析
甘藍型油菜隱性上位互作核不育系統不育系材料選育中常見的育性分離及基因型判斷
外顯子組測序助力產前診斷胎兒骨骼發育不良
管家基因突變導致面部特異性出生缺陷的原因
外顯子組測序助力產前診斷胎兒骨骼發育不良
基因突變的“新物種”
從翻譯到文化雜合——“譯創”理論的虛涵數意
人類組成型和可變外顯子的密碼子偏性及聚類分析
從EGFR基因突變看肺癌異質性
91香蕉高清国产线观看免费-97夜夜澡人人爽人人喊a-99久久久无码国产精品9-国产亚洲日韩欧美综合