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多種遺傳學檢測技術在臍血穿刺中的臨床應用研究

2022-02-14 14:23袁慧珍劉艷秋周萍王欣榮黃淑暉
江西醫藥 2022年11期
關鍵詞:臍血核型三體

袁慧珍,劉艷秋,周萍,王欣榮,黃淑暉

(江西省婦幼保健院醫學遺傳中心 江西省出生缺陷防控重點實驗室 江西省醫學領先學科建設計劃項目,南昌 330006)

據統計全世界每年有500多萬出生缺陷,我國每年出生缺陷兒100多萬,占出生人口的5%。其中遺傳因素占25%,環境因素約占10%;遺傳和環境綜合或病因未知占65%[1]。如果染色體發生數目或結構的異常,將會引起許多基因的缺失或重復,因而染色體病常表現為多種異?;蚧蔚木C合征[2]。近年隨著產前分子診斷遺傳學技術的發展,熒光原位雜交(Fluorescence In Situ Hybridization,FISH)技術、熒光定量聚合酶鏈反應(Quantitative Fluorescent Polymerase Chain Reaction,QFPCR)技術、染色體微陣列技術(Chromosomal Microarray Analysis,CMA)、低深度全基因組拷貝數變 異測序 (Copy Number Variation Sequencing,CNV-seq)等已逐漸成熟及廣泛應用于臨床,其中QF-PCR可以根據短串聯重復序列(Short Trandem repeat,STR)等位基因的個性化信息判別多余染色體的來源,鑒別母體細胞污染(Maternal Cell Contamination,MCC),也可快速診斷出目標染色體的非整倍體數目異常[3];CMA緩解了傳統核型分析的壓力,同時在深度上更詳細地對染色體數目和結構進行分析,并能綜合染色體微缺失微重復的片段位置、大小、來源及數據庫和相關文獻對其致病性進行評估[4]。妊娠中晚期抽取臍血進行染色體分析是產前診斷的主要方法之一,本文對576例胎兒臍血染色體檢查的結果進行了回顧性分析,現報告如下。

1 資料與方法

1.1 一般資料 2019年1月至2021年4月在江西省婦幼保健院產前診斷中心行臍血穿刺的孕婦576例,均進行染色體核型分析、QF-PCR及CMA檢測,孕周≥24周,年齡18~39歲;若無創DNA提示胎兒性染色體異常,同時進行FISH檢測。臍血穿刺指征:超聲提示胎兒發育異常、夫婦之一為染色體異常攜帶者、母血中胎兒游離DNA檢測(non-invasive prenatal test,NIPT)陽性、不良生育史等。所有孕婦均簽署知情同意書。

1.2 方法 在超聲引導下抽取2~4 mL臍血標本進行染色體核型分析、QF-PCR及CMA檢測;若無創DNA檢測結果提示性染色體異常,同時進行FISH檢測。查詢國際數據庫包括DECIPHER、Database of Genomic Variants (DGV)、Online Mendelian Inherit-ance in Man(OMIM)、UCSC Genome Browser、ENS EMBL等進行致病性分析,依據ACMG(American College of Medical Genetics and Genomics)判讀指南進行CNVs致病性的判讀。

2 結果

2.1 染色體核型與FISH結果 在576例臍血穿刺中,經染色體核型分析共發現染色體核型異常78例和染色體多態性變異42例,胎兒染色體核型異常檢出率13.54%(78/576),其中染色體數目異常占78.20%(61/78),染色體結構異常占21.80%(17/78);常染色體異常占66.67%(52/78),三體綜合征占65.38%(51/78),其中最多的是21-三體綜合征,占51.28%(40/78);性染色體異常占20.51%(16/78)。FISH結果與染色體核型結果一致。見表1。

2.2 染色體微陣列分析結果 與核型分析結果不一致且具有臨床意義的拷貝數變異21例,額外增加了3.65%(21/576)的異常檢出率。見表2。

表1 染色體異常核型及多態性變異核型

1例臍帶血存在一定比例的母源污染,通知孕婦重新取樣檢測,重新取樣后的檢測結果與染色體核型結果一致;其他均無母體細胞污染。無法判斷是否存在18號染色體數目異常2例,其余與染色體核型結果一致。

3 討論

染色體是遺傳物質的載體,由DNA和蛋白質等構成,具有儲存和傳遞遺傳信息的作用。如果染色體發生數目或結構的異常,將會引起許多基因的缺失或重復,因而染色體病常表現為多種異?;蚧蔚木C合征,又稱為染色體綜合征[2]。

本研究中,在576例臍血穿刺中,檢出染色體核型異常78例和染色體微缺失微重復綜合征21例,胎兒染色體異常的檢出率為17.19%(99/576),其中胎兒染色體核型異常檢出率13.54%(78/576),染色體微陣列分析提高了3.65%(21/576)的異常檢出率。胎兒染色體異常的檢出率略高于周俊[5]等的研究結果。本文研究對象主要為超聲提示胎兒結構異常和NIPT陽性的孕婦,有研究表明:超聲結構異常的染色體異常檢出率高于超聲非結構異常的檢出率;當超聲結構異常出現兩項及以上時,染色體異常發生率會明顯增高[6]。NIPT用于檢測胎兒常見的非整倍體及部分性染色體異常,敏感度:21-三體為0.994(0.983-0.998),18-三體為0.977(0.952-0.989),13-三體為0.906(0.823-0.958);特異性均達到0.999以上[7]。本研究中染色體微陣列分析提高了3.65%(21/576)的陽性檢出率。與相關研究結果相符,CMA的陽性檢出率仍然較低(并非所有病例都能發現具有臨床意義的CNV),對于超聲檢查發現結構異常但胎兒染色體核型正常的病例,目前CMA增加檢出致病性CNV的比例<10%[8]。

小額外標記染色體 (Small Supernumerary Markerchromosome,sSMC)是指在染色體核型分析中,除正常染色體外,出現的不明結構、無法辨別其來源和特征的染色體,導致染色體數量和基因拷貝數發生變化,其可來源于任何一條染色體,攜帶者臨床癥狀從無到嚴重畸形[9]。本研究中,1例核型為47,XN,+mar[18]/46,XN[32]的新發標記染色體,CMA結果顯示arr[GRCh37]1p21.1q23.1(105438124_157720286)×3,為致病性變異。孕婦及家屬知情后選擇終止妊娠。

QF-PCR技術是一種利用熒光引物對染色體上特異的短串聯重復序列(Shrot Tandem Repeat,STR)位點進行擴增,通過熒光檢測對染色體數目異常做出快速產前診斷的方法[10]。同時可以排除胎兒產前診斷樣本中的母體細胞污染。本研究中有1例臍帶血存在一定比例的母源污染,通知孕婦重新取樣檢測,重新取樣后的檢測結果與染色體核型結果一致;其他均無母體細胞污染。無法判斷是否存在18號染色體數目異常2例,其余與染色體核型結果一致。

對于懷疑嵌合的患者,取羊水或臍血等直接進行FISH檢測,不受細胞培養過程中選擇性生長的影響,可以更真實地反映胎兒體內的細胞嵌合狀況,對于判斷胎兒預后會有更多幫助[11]。目前英國臨床細胞遺傳協會已把采用間期細胞的FISH技術作為產前嵌合體檢查的篩查方法[12]。本研究中對無創DNA提示胎兒性染色體異常時,進行FISH檢測,以提高性染色體嵌合體的檢出率。

綜上所述,臍血穿刺作為孕中晚期產前診斷的主要手段,必須選擇細胞生物學或者分子生物學分析方法,明確產前診斷標本的來源,以免發生母體細胞污染。染色體核型分析與CMA相結合可以提高胎兒異常的檢出率,必要時應用FISH進行綜合分析,從而更加準確地確定染色體異常類型以及異常核型的嵌合比例,為孕婦及其家屬提供精準的遺傳學咨詢及建議,有效防止缺陷患兒的出生。

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